我觉得，两者唯一的共同点就是幻想生物，但是不同的是，兽设以动物为主题添加一些别的元素，而数码兽是可以以任何东西为主题添加任何元素，并且兽设和设计者的关系皆为母子关系，而数码兽(本吧为主)是以驯兽师和搭档为主要关系。目前的兽设主要都是狐狸或者猫要求只需要长的萌画风可爱就可以，而数码兽的形象相对夸张并且狰狞同时画风也偏向于美漫风格

兽设可以有很多但数码兽搭档只能有一个!（兽设数:4 搭档:1）

数码兽画风偏向写实，兽设偏向拟人。非官方兽设多用于娱乐甚至买卖，而非官方数码兽仅归属于个人

数码兽设定都是网络上由数据构成的。生活在网络上的数码世界里的。兽设一般都是一些猫猫狗狗之类的。数码兽设是针对《数码怪兽》设计的同人。兽设一般很萌或者写实，数码兽设一般更威猛或者更夸张。数码兽可以进化，并且有不同等级，不同属性，你看TV动漫就知道了。

数码兽，数据，说的不好听一点就是一堆代码
兽设，依据现实生活中兽类的结合体or单种变异型
当然数码兽也有很多是根据现实中的动物or古代神话来创造的
数码兽的名字往往与本身特征(形态)有关联
或者是这样说，数码兽有攻击性，兽设没有，你见过哪个兽设有技能吗

想起我说过的一句话
“拿数码兽和兽设比，就是绊了脑壳”
两者不同，存在(很大)差异，但是不好形容，看来我语文没学好