实际上，宋徽宗和蔡京主导王安石变法，后人因此把王安石变法归结为靖康支持的根本，秦桧看到了这一点，为了颠覆南宋，他决定推崇王安石，然而，如果他一开始就这样子，势必引起大众反感，于是，他在执政前推崇理学，执政后打压理学，推崇王安石

有官员认为元祐、绍圣均有失误，应该消除偏见，调和矛盾。于是改次年为建中靖国，以示“本中和而立政”，“昭示朕志，永绥斯民”。[3]但是新旧党争不仅没有停止而是愈演愈烈。
建中靖国元年（1101）十一月，邓洵武首创徽宗应绍述神宗之说，攻击左相韩忠彦并推荐蔡京为相，得到执政温益的支持，为徽宗所采纳，首先于同月末决定改明年为崇宁元年，明确宣示放弃调和政策，改为崇法熙宁变法。

宋徽宗时期，蔡京勾结宦官独专朝政。蔡京为了自己把持朝政，就给反对他的司马光、苏轼等三百零九人扣上"元佑奸党"的帽子，在德殿门外树立"党人碑"，上面刻写三百零九个党人恶名，昭示全国。被刻上党人碑的官员，重者关押，轻者贬放远地，非经特许，不得内徙。
宋哲宗元佑元年，司马光为相，尽废神宗、熙宁、元丰间王安石新法，恢复旧制。绍圣元年章惇为相，复熙丰之制，斥司马光为奸党，贬逐出朝。徽宗崇宁元年，蔡京为宰相，尽复绍圣之法，并立碑于端礼门，书司马光等三百零九人之罪状，后因星变而毁碑。其后党人子孙更以先祖名列此碑为荣，重行摹刻。

秦桧为了颠覆南宋，把王安石的“荆公新学”定为宋朝的官方正统思想，秦桧死后，宋高宗就解除了这个规定，诏自今毋拘一家之说，务求至当之论。
可见宋高宗被秦桧架空了

初，秦桧专国，其子熺廷试第一，桧阳引降第二名。是岁，桧孙埙举进士，省试、廷对皆首选，姻党曹冠等皆居高甲，后降埙第三。二十五年，桧死，帝惩其弊，遂命贡院遵故事，凡合格举人有有权要亲族，并令覆试。仍夺埙出身，改冠等七人阶官并带“右”字，余悉驳放。
程、王之学，数年以来，宰相执论不一，赵鼎主程颐，秦桧主王安石。至是，诏自今毋拘一家之说，务求至当之论。道学之禁稍解矣。

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