首先我们来看看致癌物的形成或来源。肠内10万亿的细菌组成了一个很小的化工厂，其中有害细菌会将消化的食物和体内其它物质分解为许多致癌物，最常见的有亚硝胺、吲哚、酚类、二次胆汁酸。我们也会摄入含有一些前致癌物和致癌物的食物（主要是腌、熏、烤、炸）。益生菌是怎么对付它们的呢？
第一，益生菌可以通过结合、阻断或移除来抑制致癌物和前致癌物。还可以对可能将前致癌物转化为致癌物的细菌及转化酶的活力进行抑制。说的简单点，益生菌可以吸附致癌物和对致癌物质进行加工或转移，减弱它们的毒性。益生菌能够帮助身体远离有害细菌和有害的酶，它们就没有加工致癌物的机会了。最典型的例子就是益生菌能降低粪便酶的活力，有效预防结肠癌。
第二，益生菌能酸化肠道，调节肠道菌群，从而减少有害菌的数量和改变胆汁溶解性。使胆汁减少向致癌物二次胆汁酸的转化。
第三，益生菌能促进肠道蠕动，加快对粪便中有害的致癌物的排出。