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Label free定量蛋白质组学技术

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非标记定量(Label free) 蛋白质组学技术:Label-freequantitativeproteomics(Labelfree)technolog
定量蛋白质组学是蛋白质组研究的重要内容,通过对基因表达产物——蛋白质的定量分析,以了解基因在不同的生理、病理和逆境条件下的表达情况。近年来,随着非凝胶技术的发展,“鸟枪法”蛋白质组学(“Shotgun”proteomics)技术,特别是多维蛋白质鉴定(Multidimensional Protein Identification,MudPIT)已成为研究复杂生物样本中大规模蛋白质表达和定性和定量分析的强有力工具。
在非标记策略的定量模型中,主要涉及两种不同的算法:其一,以肽段的色谱峰积分面积为基础,通过比较一对生物样品中相对应到蛋白质酶解多肽的色谱积分面积而得到两者的相对丰度;其二,以肽段被质谱检测的计数为基础,通过归一化来表征被检测蛋白质的相对丰度。非标记技术认为肽段在质谱中被捕获检测的频率(Counts)与其在混合物中的丰度成正相关,因此蛋白质被质谱检测的计数反映了蛋白质的丰度,通过适当的数学公式可以将质谱检测计数与蛋白质的量联系起来,从而对蛋白质进行定量。
Labelfree技术蛋白质组学应用:
1.需要快速在大量样本中找到差异表达的蛋白集合。
2.需要在较短时间以较低成本得到具有提示意义的蛋白表达数据。
3.需要检测的样品蛋白含量低。
4.需要检测相互作用蛋白。
label free技术特点:
1. 对质谱仪器设备要求较高,色谱和质谱需要同时有较好的稳定性和重复性。
2. 需要有特殊的定量分析软件。
3. 对样品中蛋白质总量要求较低,实验周期短,实验费用低。
4. 不需要额外并且昂贵的标记试剂,排除了标记过程带入实验误差的风险,同时也不必考虑标记效率的问题。
LabelFree基本原理:

LabelFree 蛋白质组学定量技术流程:

内容来源:知乎


1楼2018-11-23 15:34回复
    Label-free技术服务参考平台:百泰派克生物


    2楼2018-11-23 15:35
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