马来西亚坐落东南亚，北纬1-7度，东经100-119度，各城市属东八时区，与北京无时差。疆土被南中国海分隔成东、西两部分。西马坐落马来半岛南部，北与泰国接壤，南与新加坡隔柔佛海峡相望，东临南中国海，西濒马六甲海峡。东马坐落婆罗洲北部，与印尼、菲律宾、文莱相邻。马来西亚世纪大学西马和东马隔海相望，最近处相距 600 海里。疆土总面积约33万平方公里，其中西马13.2万平方公里，东马19.8 万平方公里。全国海岸线总长4192公里，陆地鸿沟长2669公里。
马来西亚阳光充足，气候宜人，旅游资源非常丰厚，具有许多高质量的海滩、奇特的海岛、原始热带丛林、宝贵动植物、千姿百态的窟窿、陈旧的风俗民风、悠长的历史文化遗址以及现代化的都市。首要旅游点有：吉隆坡、云顶、槟城、马六甲、浮罗交怡岛、刁曼岛、热浪岛、邦咯岛等。
马来西亚属热带海洋性气候。终年高温多雨，白日均匀气温31—33℃，夜间均匀气温23—28℃，高原地区的夜间气温可低至16—18℃。全国均匀年降雨量为2000—2500毫米，每年10月至次年3月刮东北季风，为旱季，降雨较多;4—9月刮西南季风，为旱季，降雨较少。马自然条件优胜，植物旺盛，物种繁复，森林覆盖率达75%以上。
西马地势北高南低，山脉由北向南直通，将马来半岛分成东海岸和西海岸两部分。滨海为宽广的冲积平原，土地肥美。中部为山地，由西向东摆放分别为滨登山脉、中央山脉、本农山脉、大汉山脉、东部山脉。西马最高峰为大汉山，海拔2816米。坐落彭亨州的彭亨河为马第二大河流，全长434公里，流域面积29137平方公里，骨干河流发源于大汉山，注入南中国海。
东马为森林覆盖的丘陵和山地，西部滨海为冲积平原。全境河流布满，水力资源丰厚。克罗河山脉直通南北，主峰基纳巴鲁山，海拔 4095 米，为东南亚最高峰。坐落砂捞越州中部的拉让江为马第一大河流，全长592公里，流域面积39000平方公里。
全马分为13个州和3个联邦直辖区。13个州分别是西马的柔佛、吉打、吉兰丹、马六甲、森美兰、彭亨、槟城、响雷、玻璃市、雪兰莪、登嘉楼和东马的砂捞越、沙巴。除马六甲、槟城、砂捞越、沙巴4个州外，其余9个州都有世袭苏丹。3个联邦直辖区是首都吉隆坡、东马的纳闽及联邦政府行政中心—布城。13个州中面积最大的是砂捞越(12.4万平方公里)，最小的是玻璃市(795 平方公里)。