1、上课时间为 3月28日 下午14:00——16:00；晚上19:00——21:00
3月29日 下午14.:00——16:00；晚上19:00——21:00
（每次课程后半个小时，会解决大家的一些问题）
日期 授课题目 授课内容
第一天3月28 转录组学前沿概述 1. 转录组技术发展前沿动态
2. 转录组应用案例及应用热点
转录组学实验和分析基础 1. 转录组学研究的实验技术
2. 转录组技术流程及技术细节（重点讲解）
3. 常用的转录组测序建库技术
Linux基础操作 1. Linux基础操作
De novo转录组数据分析上机实践 1. 原始测序数据的检测和预处理（重点讲解）
2. 使用Trinity拼接转录组数据（重点讲解）
3. 原始数据与拼接转录本的比对（重点讲解）
4. 表达量统计和差异表达分析（重点讲解）
第二天3月29 Reference based转录组数据分析上机实践（一） 1. 转录组数据准备和软件介绍
2. 使用Tophat进行转录组数据的比对（重点讲解）
3. 用IGV查看比对结果
4. 使用cufflinks进行表达量估计和分析（重点讲解）
5. 差异表达基因的功能分析（重点讲解）
circRNA测序与数据分析（包含上机实践） 1. circRNA目前的应用、发展历史以及circRNA的定义
2. circRNA产生的生物学过程（重点讲解）
3. circRNA的测序（重点讲解）
4. circRNA测序数据分析软件（重点讲解）
5. circRNA的预测（重点讲解）
中國醫學科學院 北京協和醫院 刘主任
曾担任美国葛兰素史克制药公司项目主管、香港大学李嘉诚医学院研究助理教授。
主持国家自然科学基金、北京市自然科学基金、香港RGC基金项目。主要研究方向包括药用真菌/药用植物基因组学、生物信息学和中药信息学。获得省部级一等奖2项。2017年3月起，组织协调由医科院和美国Illumina公司合作开展的国际“千种药用植物基因组研究计划”。已发表SCI论文40多篇，包括Nature Communication、Science、PNAS等杂志。已获得软件著作权、专利七项。
感兴趣的同学可以加我QQ：1239568954
3月29日 下午14.:00——16:00；晚上19:00——21:00
（每次课程后半个小时，会解决大家的一些问题）
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第一天3月28 转录组学前沿概述 1. 转录组技术发展前沿动态
2. 转录组应用案例及应用热点
转录组学实验和分析基础 1. 转录组学研究的实验技术
2. 转录组技术流程及技术细节（重点讲解）
3. 常用的转录组测序建库技术
Linux基础操作 1. Linux基础操作
De novo转录组数据分析上机实践 1. 原始测序数据的检测和预处理（重点讲解）
2. 使用Trinity拼接转录组数据（重点讲解）
3. 原始数据与拼接转录本的比对（重点讲解）
4. 表达量统计和差异表达分析（重点讲解）
第二天3月29 Reference based转录组数据分析上机实践（一） 1. 转录组数据准备和软件介绍
2. 使用Tophat进行转录组数据的比对（重点讲解）
3. 用IGV查看比对结果
4. 使用cufflinks进行表达量估计和分析（重点讲解）
5. 差异表达基因的功能分析（重点讲解）
circRNA测序与数据分析（包含上机实践） 1. circRNA目前的应用、发展历史以及circRNA的定义
2. circRNA产生的生物学过程（重点讲解）
3. circRNA的测序（重点讲解）
4. circRNA测序数据分析软件（重点讲解）
5. circRNA的预测（重点讲解）
中國醫學科學院 北京協和醫院 刘主任
曾担任美国葛兰素史克制药公司项目主管、香港大学李嘉诚医学院研究助理教授。
主持国家自然科学基金、北京市自然科学基金、香港RGC基金项目。主要研究方向包括药用真菌/药用植物基因组学、生物信息学和中药信息学。获得省部级一等奖2项。2017年3月起，组织协调由医科院和美国Illumina公司合作开展的国际“千种药用植物基因组研究计划”。已发表SCI论文40多篇，包括Nature Communication、Science、PNAS等杂志。已获得软件著作权、专利七项。
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