楼主的观点和我写的宫野一家的分析居然有高度重合的地方。
我一直认为贝姐是灰的，她憎恨A药，曾经想追杀灰原，可是多次放过红方，而且灰原都送到她面前了，她也隐瞒了事实，说明她压根没有认真的去追杀灰原。
贝姐想要摧毁组织，但是一直没有可靠的伙伴，属于孤军奋战的地步。而灰原立场的转变正好为她提供了向红方知会情报的重要机会。灰原已经有了主动摧毁组织的意向，正好工藤新一暴露，所以在小林贝姐论成立的情况下，恐怕贝姐是主动去找小哀接头的。她不是不知道小哀怕她，但是在她自己已经有了不杀小哀的保证以后(说不定其实她也压根就没想真的杀掉小哀)，她最好的接头人就是小哀，而小哀应该是在贝姐一出现就认出了她，在“小林老师”提到玛利亚的时候，灰原就已经在观察她了。贝姐提供的情报红方不一定会信，而且她也不会全部都提供，但对于同样组织出身，同样都是组织高层(雪莉曾经在组织的地位肯定很高)，贝姐有足够的理由信任小哀

我勒个去，重看m13重大发现，在柯南说信任贝姐之后，小哀……笑了

我勒个去，有一件事情细思极恐，雪莉是以灰原哀的身体见贝尔摩德的，而且贝姐很明显一看到灰原哀就知道她是雪莉，可是这样不就说明A药暴露了吗而雪莉和贝姐的交易也很有意思，雪莉认为自己死了大家就可以解脱，然后让贝姐杀了自己，条件就是贝姐要放了其他人，贝姐居然答应除了茱蒂老师其他全部放过
可见雪莉是了解贝尔摩德的，她知道这个交易会有成功的可能性，你看雪莉从来就不和琴酒做交易。而满月篇以后贝姐居然一直隐瞒A药和雪莉变小的事情，这是何居心？
话说，雪莉虽然对贝姐有很强烈的雷达反应，但是雪莉好像从来没和柯南提过贝姐很危险
而且她不反对去见新出医生

感觉楼主因为私心喜欢贝尔摩德而影响了判断，我觉得贝姐黑没得洗，虽然楼主认为贝姐可能没杀朱迪父母（仅因为青山没有画出那个具体镜头）但是列车篇贝姐确确实实按下炸弹按钮，想要到终点前、不等琴酒伏特加下手，自己就炸死灰原，至于灰原是基德假扮的，那是她意料之外的事情，但是她想杀雪莉的心和按下按钮的动作都是表面她确实是要杀人的。作为酒厂boss最亲密的人，多年保持出淤泥而不染、不染鲜血，赤井秀一是不可能说她是“烂苹果”的，要不然就是她其实没吃药，老年沙朗和她就是两个人，沙朗杀的人她没杀，但朱迪爸爸眼镜指纹就没法解释了。所以她手必定已染鲜血，作为子供向的漫画不可能不让她伏法。个人感觉还是牺牲对她比较好。

另外，酒厂雨天暗杀政治家的时候，贝尔摩德也坐在琴酒车后，她说她来是为了确保任务能顺利进行，还提醒两个狙击手不要搞砸，最后只能让她出手。既然酒厂是一个这么计划周密的组织，让贝姐作为两个日常任务仅为狙击的人的plan b，说明贝姐的经验和手法是得到boss的肯定的。桥上喂药，有可能是青山的恶趣味，和赤安在烟火摩天轮下打架同理，假如贝姐真真手上一滴鲜血都没有，完全没有虾仁经验，boss怎么可能派她杀mi6的玛丽呢？连日本牛郎店的罗兰都知道，客人花大价钱买call时，是不能让新人做开场的，很可能因为不熟而引起客人不开心（偏一下题哈哈。我觉得贝姐不是非黑即白的人物，毕竟就算现实中人性也是很复杂的，她教校长健身操不能抹去她杀过人的事实，不是纯黑但偏灰，绝对最后不可能为白，因为这毕竟是个子供向的漫画，根据柯南其他篇章犯人的后果，不管你是因为什么犯罪、犯了什么罪，一定要接受法律的惩罚。这就是我觉得贝姐很难洗白的原因。青山没法洗。

我是觉得贝姐确实可能主动对付组织，但最后还是不得不伏法，一是因为红方很可能不领情，二是按贝姐的性格最后也不会告诉红方自己为他们做的事。关于秀一对贝姐了解多少，我觉得不会超过读者的了解，就算知道是叛徒也依然是杀人犯，因为他的价值观应该跟青山差不多，毕竟满月篇教唆杀人且成功了。另外“腐烂的苹果”好像是朱蒂起的名字？（朱蒂削苹果打电话那里，说代号还没想好，干脆就叫...）如果朱蒂父母和贝姐无关，FBI勉强可以放过她，日本境内的那些事情怎么算就得看公安了。所以我感觉在青山的世界观下沾血的组织反对者最位置尴尬也最不幸，血债一件都少不了，红黑两面还都不讨好，还不如琴酒之流活得痛快

我觉得她的结局肯定不是好的（这样其实更好，不尬洗，这种亦正亦邪的角**e才最具人气）
关于反对组织这一点，我认为她只是反对组织想要开发违背生理和伦理的药物，组织很庞大，青山也说过关于贝姐设定很复杂，她有什么不为人知的往事，和boss具体什么关系，为什么会服药，这些都影响了她决战篇的一举一动，不能用简单的她恨药物→她反对组织→她帮红方搞垮组织。她想要毁掉的是药物还是整个组织？又或者只是boss？这些都太难讲了。

睡不着再写一点吧
凭青山说过的贝姐设定很复杂，以及满月篇柯南说的“那女人的神情看起来很落寞，好像在怀念什么”。我觉得就不能把贝姐简单理解成被策反的酒厂员工。
卧底也好，爱尔兰那种被策反的员工也好，他们对组织谈不上有任何感情，拿钱按命令办事，给资本家打工而已。
贝姐不一样，她和boss的羁绊甚至可以说是柯南里最深的一对吧？
你说贝姐结局会帮助红方捣毁组织，这点没太大争议，但是捣毁到底是巴不得组织连同boss和其他员工一起game over还是组织的黑色交易全部被捣毁呢？
卧底和叛徒可以任由boss去死，贝姐未必，她希望结束的是黑暗无边的这一切，但是组织让她干的事她还是会干，朱蒂父母的事到底真相如何不重要，即使不是她干的，她也不会因此被洗白，不会被简单策反
我一直觉得她希望的组织覆灭是连同自己生命一起的覆灭，而不是乌丸集团赶紧倒台老娘要自己逃出去潇洒的那种。
还有就是红方对应的是黑方，贝姐无法融入任何一个红方组织，如果她摇摆不定的立场被boss知道，她两边不是人，两边都容不下她的。红方≠善良正义的道德天花板，楼主说的贝姐洗白和贝姐加入红方完全两码事
如果故事最后变成贝姐在红方阵营看着乌丸gg，说实话我觉得很烂尾
我觉得她比较理想的结局是死自己人手里，换来部分平静
ps.什么给新兰挡子弹死了也最好不要了吧，太俗了。