又发现阴阳除了相对立的两个方面外，又存在着互根、消长和转化。阴阳互根即相互依存是指一切事物和现象中的对立两方面又都具有互相为用的内在联系，它们相互的存在是在对方的存在下为前提。
例如，没有动就没有静，没有大就没有小，没有男就没有女，没有生就没有死，没有善就没有恶，没有刚就没有柔等等。
阴阳消长是指一切事物和现象都在运动和变化之中，你强我弱，你增我减，此消彼长，如春夏秋冬，周而复始，寒来暑往，秋收冬藏。阴阳转化是指阴阳对立的双方在一定的条件下，彼此互相影响改变原有属性。
例如，仇敌转化为朋友，由弱小转化为强壮，山川转变海洋，坏人变为好人，青年变为老人等等。

阴阳的对立、互根、消长、转化是一切事物发展的必然的规律。奇门遁甲预测的根本原理，就是对阴阳这种特性规律的把握和认知。阴阳做为一种信息符号，始终贯穿在奇门遁甲象数理模型中。例如奇门遁甲将夏至后所用之局称为阴遁，冬至后所用之局称为阳遁，又按阴阳将九宫八卦分为内盘和外盘，阴遁之局将九、二、七、六宫称内盘，代表事物现在发生的过程及结果。将一、八、三、四宫称为外盘，代表事物将来的发生过程及结果。阳遁之局正好相反，其他如星、门、奇、仪等也都按阴阳划分

阴阳这种特性具体体现在五行中，五行即金、木、水、火、土。五行的最初含义，是古人对自下而上的基础物质的状态及属性的直观认识，也就是说五行是人生日用不可缺少的五种物质。
作为抽象的信息符号是后来才有的，为了提示事物和现象的变化规律，古人采用了此类取象的方法，把所有的事物和现象都归纳到这五大类即五行中去，而所有的事物和现象（包括人在内）的发展变化都是这五种不同的物质不断运动和相互作用的结果，这五种不同物质不断运动相互作用产生了我克、克我、我生、生我、比和的五种变化关系，这种变化关系是一个永恒的定律。