神拳门所谓神拳，即花拳绣腿。这种花拳绣腿不是通常所说表演的那种“花拳绣腿”。这拳打不实，用意而不用力，如游龙一般，是崆峒派拳术中登峰造极的功夫。此门中同样有拳、掌、刀、枪、剑、棍、铲、钩、鞭等十几种套路。
花架门是在神拳门的基础上脱颖而出，结合敦煌画上的飞天造型而创立的一门集攻击与欣赏为一体的上乘功法，其造型优美，攻击巧妙，尤适于女性习练，花架门中有桃花扇、花架拳、花架枪、花架剑和龙凤双钩十几个套路。
奇兵门是崆峒派武术最具特色的一门，其特点在于所用兵器短小及排兵布阵以阵法，其中兵器有风火五行轮、风火扇、挎虎篮、飞爪、佛尘、九齿铁耙、连枷、铁琵琶、分水娥媚刺、翻天印、太统法铃等。阵法有太极阵、八卦阵、十二生肖阵、二十四天魔阵、三十六游龙阵、四十八降妖阵、六十四卦齐天阵、八十一通天奇门遁甲阵、七星回天阵、二十八宿造天阵、十套阵法等。
玄空门玄空门是崆峒派秘传之宝，多以历代掌派独修之功法。其内容有古太极八式（崆峒太极）、无相神功、和达摩神功等，以此修炼内功。以针灸，中药、易经、气功结合而成的疗病方法《易通疗法》，是崆峒山镇山之宝，其中针灸取用《灵龟法法》，《子午流注》之时辰、穴位、脉络，借以《易经》之卦相推断，配合气功引导助力，在用几尾中草药服用，达到疗病奇效；以藏传佛教密宗之咒语，手印为主的修心之法，历来为崆峒派所重视，是达到天人合一境界的必修法宝。此法以《金刚七句》《一切如来陀罗心秘密咒》及《莲花生大师咒》为主课，每咒以八十万遍为阶梯，直至心空如宙，体同大宇为止。达到大智大勇，大慈大悲，大彻大悟，大雄大力的佛之境界；在做人处世上讲求儒家仁、义、礼、智、信五大法度。在修性上以道家所精释的道法自然，空同如如要述，达到无我无相，无执无着的境界，玄空而玄空，意空而识空，乃至真空，方显神通，为苍生服务。