不说别的，在水的阻力下总结出牛顿三定律，或者万有引力定律，需要经历多么大的“阻力”，可能我们怎样也想象不到。它们要么需要在海洋表面生存，要么需要上岸(但是这颗星球可能没有陆地)，要么就要建立海底空气井实验室，而这反过来又需要较高的技术水平，深海智慧生命的科学启蒙可能要依赖于海底的自然空气井。
从能量的角度来看，空气的导热率极低，是水的两千多分之一，体积比热极低，是水的大约四千分之一，也就是说相比于水环境，空气环境可以将大量能量聚集在一起并维持很长时间，也就是题主提到的化学反应和冶炼环境的基础。氧气又可以充当氧化剂，水……不捣乱就不错了。
从生物形态的角度来看，水中的移动阻力很大，生物往往都会进化成低阻力外形，而这样的流线型几乎不能支持“手”的诞生，没有了进行复杂灵活精密工作的工作肢，那么你空有智力，也无法创造什么和流传下什么，智慧无法完成原始积累，就不具有形成高等文明的条件，例如海豚与鲸。章鱼有灵活的腕足(工作肢)，其智商相当高，但是作为水下无脊椎动物，它已经很努力了，甚至有部分章鱼已经懂得群居了，可怕。
还有一点，关于生态位。即使是陆地生物，也不是一直都那么聪明，如果资源充足的话，生物都是愿意向巨大体形方向发展的，想想从前的巨大昆虫与恐龙。当它们占据了最高的生态位时，其它生物根本没有反抗的余地，智慧的火苗出现又熄灭，那么它们唯一反扑的机会是什么呢？
大灭绝。
大灭绝一般搞的就是那些大家伙，天灾来了，大量生物死亡，资源极度匮乏，体型巨大的瞬间饿死，只剩下小型生物蝇营狗苟，然后再发展。
人类始祖诞生于冰河世纪前后，这是一次又一次洗牌才最终得来的巧合和必然，终于有生物领跑者在大岔路口从力量型向智慧型发展，并最终占据了最高的生态位。
于是重点来了，海洋生物由于其环境的“优越性”，其经历大灭绝受到的冲击比起陆地要小得多，也就是说智慧生物翻盘的机会也要少得多。
海洋智慧生物的前途黑暗，任重而道远啊。
当然，不排除是人类的思想墨守成规了，深海生物可能以另一种想象不到的方式发展出高级文明。