菌群移植中菌群的活性最为关键，直接影响疗效。有研究，利用经流式细胞仪对冻干粉与活菌肠溶胶囊进行检测，冻干粉活性40%，液体活菌肠溶胶囊活性95%，菌群活性低，对改善肠道菌群结构效果微乎其微，高活性必然使得效果率增高。

冻干粉，出厂报告显示菌群有效活性。但是，前段时间报道活菌率不达标，因为冻干菌群是将细胞内壁水分抽除，使得细菌皱缩、变形；复温后能否恢复原有活性，有待商榷。
液体活菌肠溶胶囊，出厂报告显示高菌数，高活性。因为菌群有厌氧性，承葛医药集团将自主研发的冻存保护液，装入胶囊后其实就等于是厌氧环境。不仅让菌群在储存在厌氧环境，还保证菌群-80℃条件下不会被低温冻伤且保护活性，全面保护菌群活性。
液体活菌肠溶胶囊（承葛医药集团），单粒胶囊菌群活性最高可达 2 千亿，单次移植40粒最低可达到8万亿，达到一次性移植总肠道细菌20%的目的，并能有效避开胃酸，定点释放肠道内。

肠道菌群是活的微生物，从生产到服用，每个环节都会有不同程度的损耗其活性，最终在肠道内定植的菌群才能真正发挥作用！
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