肝肠孢虫是一种微孢子虫，寄生于南美白对虾肝胰腺小管上皮细胞中，全称“肠道上皮细胞微孢子虫”，大小为1.1±0.2μm～0.7±0.1μm，因其主要侵入虾的肝脏，故简称虾肝肠孢虫。
肝肠孢虫能在虾细胞中形成孢原质，并起到自我保护的作用。研究发现，虾肝肠孢虫主要寄生在虾肝胰腺上，不仅影响虾的正常生长，而且容易引起继发性细菌感染。虾感染肝肠孢虫后，严重影响消化吸收功能，它所吃的食物很难通过消化吸收成为虾体的机体，导致生长缓慢，饵料系数差，成虾商品价值低，产量下降，造成严重的经济损失。
肝肠孢虫寄生通常不会导致南美白对虾死亡，这很容易被养殖朋友忽视。根据现有研究报告，肝肠孢虫与白便综合征之间也存在一定的相关性。同时，肝肠孢虫的检出率与南美白对虾的缓慢生长呈现明显的正相关性。
对于虾肝肠孢虫病的诊断，首先是观察虾是否生长缓慢，以及同一池塘中是否有不同大小的虾。如果存在上述现象，需要通过实验室检测进一步确认。由于肝肠孢虫体积较小，因此使用光学显微镜对其进行虫体的形态观察。
目前，对感染肝肠孢虫的对虾尚无良好的治疗方法，因此防控孢子虫病的关键是去除环境中的孢子虫卵囊，防止对虾反复感染。养虾可以通过多换水（如果有相对良好的水源）或降低水体富营养化程度来达到这一目的。
1、养殖朋友应做好苗期虾苗的筛选和检测工作，避免购买携带病原体的虾苗。
2、做好虾池的清淤和调水工作，降低养殖水中有机质含量，尽量减少孢子虫病形成反复感染的机会。
3、对虾肝肠孢虫的抑制也要找准时机，尽早处理，一般在10³以内，控制是比较好的，拌料内服乐畅桉树精油，以驱代杀，对肝肠孢虫进行防控和抑制，同时防止对虾的继发性感染，使对虾健康生长。
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