在众多砚坑中最有名的是老坑（水岩）、麻子坑、坑仔岩，被称为三大名坑，这些明坑的坑料是最好的。
1、老坑
又称水岩、皇岩，位于西江羚羊峡斧柯山南岸山脚，离西江约200米，位于端溪矿区。开采于唐代中期。砚石呈紫蓝带青色；石品花纹有天青、鱼脑冻、蕉叶白、青花、玫瑰紫、冰纹、火捺、金银线、翡翠以及石眼等。
2、坑仔岩
又名康子岩，位于老坑之南半山上，距老坑洞约600米。开采于宋代治平年。坑仔岩砚石质优、细腻坚实、滋润、青紫带红；石品花纹有天青、鱼脑冻、蕉叶白、青花、火捺，尤以石眼多称著。
3、麻子坑
位于老坑之南3000多米的山腰上，在端溪矿区最高处旗顶下，坑口标高380米。分旱洞、水洞，有多个洞口。开采于清代乾隆年间。
石色青紫略带蓝，佳石中有天青、鱼脑冻、蕉叶白、青花、火捺以及石眼等，其中石眼碧绿。
4、宋坑
位于肇庆七星岩北面的北岭山—带，西起小湘峡，东至鼎湖山，主要有浦田青花、榄坑、盘古坑、陈坑、伍坑、东岗坑、前村坑、蕉园坑等，因开采于宋代，因石色相近，统称为宋坑 。
宋坑砚石色泽紫如猪肝，凝重浑厚；硬度为肖氏40—60，优质的砚石细润，有火捺、猪肝冻、金钱火捺等石品。
5、梅花坑
其砚石色泽主要呈苍灰色或土黄色，最突出的特征是石眼多而且个头大，一般是椭圆形，如食指头大者并不少见，石眼颜色多为黄色或青黄色，色晕不像鸲鹆眼那样多重和层次分明
6、绿端
绿端石简称“绿端”，是一种绿颜色的端砚石，而在绿端石的边缘，往往有红色或黄色矿物质渗入，有的只是薄薄的一层石皮，有的却形成为较厚的一个外层。
7、白端
白端石简称“白端”，是一种纯白色的端砚石，外表有点像汉白玉，但是比汉白玉更纯净细腻。白端石产于肇庆市星湖风景区内的七星岩。
除以上介绍的坑种外，较为人熟知的还有宣德岩、朝天岩、冚罗蕉、白线岩、有冻岩、古塔岩、斧柯东诸坑等。