企业内部审计主要内容包括：风险评估、内部控制评价、合规性评价、业务流程审计、财务审计、信息技术审计等。审计师通过对企业的内部运营流程、财务状况和管理制度等方面进行检查和评估，为企业提供有价值的建议和改进方案。