薄层色谱鉴别大黄的过程是先将大黄样品进行提取，然后将提取液用毛细玻璃管吸取到薄层色谱板上，再将色谱板放入色谱槽中进行分离。随后，将色谱板取出，喷洒显色剂并在紫外灯下观察色谱板上的斑点，通过对比样品与标准品的斑点位置和颜色，来判断样品中是否含有大黄。