叶利钦不同意车臣独立主要是因为以下几个原因：损害俄罗斯的国家利益：俄罗斯拥有丰富的石油和天然气资源，车臣位于俄罗斯南部地区，车臣独立将会使俄罗斯失去对这些资源的控制权，对俄罗斯经济造成很大的损失。损害俄罗斯的领土完整性：车臣作为俄罗斯联邦的一个共和国，独立将会对俄罗斯的领土完整性产生威胁，其他俄罗斯共和国也可能效仿车臣的做法，这对俄罗斯的统一和稳定都会造成威胁。制止分裂活动：车臣独立主张者中有极端分子，他们试图通过武力手段分裂俄罗斯，因此俄罗斯政府采取了多种手段来制止这些分裂活动，其中包括采用军事力量进行镇压。总之，叶利钦不同意车臣独立的主要原因是保护俄罗斯的国家利益和领土完整性，以及制止分裂活动。