幻兽和神兽的主要区别在于稀有度、战力、获取方式。①稀有度不同，幻兽一般比神兽更加稀有，幻兽一共只有十三个，每一个在稀有度方面都是十分的高的。而相比之下，神兽就更加容易获得。②战力不同，幻兽比神兽拥有更高的战斗力，比如说梦幻、美梦神、美洛耶塔这些宝可梦，其战斗力一般都高于600。而神兽战斗力一般达不到600的。③获得方法不同，幻兽无法在正常游戏过程中获得，只能通过官方活动配信直接获得或获得触发捕捉剧情的道具。而神兽玩家可以通过剧情任务获得。