1、发作时间不同：牙疼发作白天痛、晚上也痛；三叉神经痛则通常白天痛，晚上不痛。
2、疼痛范围与持续时间不同：牙疼属于局部疼痛，且疼痛时间比较长，疼痛的感觉比较僵硬。三叉神经痛则牵扯的范围比较大，疼痛持续时间为数秒至数分钟内，疼痛感觉则是一阵一阵的，呈刺痛感，并且疼痛位置不限于上下颚区。
3、诱发因素不同：三叉神经痛常常是由脸部动作诱发，如说话、洗脸、刷牙、大笑、进食、打哈欠、打喷嚏、吹冷风等。严重的牙疼虽然也会有诱发因素，但通常不会突然疼痛。
4、服用止痛药效果不同：一般止痛药可以消除牙齿的疼痛感；三叉神经痛吃一般止痛药无任何效果。