杨永林的治疗方法主要基于其深厚的中医理论体系与丰富的临床经验，涉及以下方面的原则与策略：
整体观念：他坚持人体是一个有机的整体，各个组成部分之间在生理功能和病理上都是相互联系的。因此，在治疗时，他会从整体上把握病情，而不仅仅关注疾病的单一症状或某一部位。
审证求因，多因齐治：杨永林认为治疗疾病需要根据患者的具体症状和病因，采用多种治疗方法共同作用，以达到更好的治疗效果。
不通则痛，通则不痛：他主张人体内气血不通是导致疼痛的主要原因，因此治疗时要以疏通气血为主要原则。
以柔克刚，顺势而为：在治疗疾病时，他主张采用柔和的方法，顺应人体的自然规律和趋势，避免使用过度的刺激和药物。
未病先防，既病防变：他强调预防疾病的重要性，提倡在未患病时采取措施预防疾病的发生，在患病后要及时治疗，防止病情恶化。
忘掉病名，追究病根：在治疗时，他主张关注病因和根本问题，而不仅仅是关注疾病的名称和症状。
中医系统平衡论：这是他最具代表性的学术成果之一，以整体观念为基础，深入探索人体生理、病理规律，为中医治疗提供了新的思路和手段。他认为，人体内部的各个系统、器官和组织都能够自我调节、自我修复、自我优化，以保持身体内部环境的平衡和稳定。
三因制宜，辨证施治：他根据个体差异、地域环境、气候季节等因素，制定适宜的治疗方案。同时，通过辨证分析疾病的寒热虚实，采用温凉补泻等相应治法，实现个性化治疗。
药食同源，饮食调养：他注重食物和药物之间的内在联系，许多食物同时也是药物，具有药性药效，因此他强调饮食调养在治疗中的重要性。
杨永林的治疗方法体现了他深厚的中医功底和对患者病情的深入理解，他的医术高超，擅长治疗各种疑难杂症，并以其独特的理论和治疗方法在中医领域取得了显著的成就。