故事以某所农学院为舞台，讲述一个该学校的学生泽木直保在学园里的日常生活。
他拥有可以看见常人看不见的“菌”的特异体质，而且能够听懂“菌语”……
这种能力在直保所从事的领域简直可以称为“媲美3亿元电子显微镜的能力”，从而引起了一系列小小的骚动。
作者用平缓的笔触向我们展现了与我们人类共存的“菌世界”，本作清新可爱，搞笑的同时也轻松的介绍了很多科普知识，如一些日常生活中的发酵小知识。
各种“菌”不仅造型可爱，而且有自己的思想，还可以说话，口气也十分狂妄：“酿了你哟！”^^。