宋初，废道设路，路辖府、州、县，馆陶县属河北路大名府。
公元988年，查道考中进士及第，任馆陶尉。查道，字湛然，安徽歙州休宁人。他一向廉洁耿介，在馆陶做官期间，常与妻子一起采集野菜回家掺米面做成稀粥充饥，百姓深受感动。
公元1004年（宋景德元年）闰九月，辽圣宗萧太后率军二十万大举南侵。途径馆陶、永济，在今北馆陶南五里筑城。馆陶一带传说辽军每人一盔土，筑成盔按城，亦称驻马城，后人以萧后曾在此驻扎指挥军事而名之“萧城”。“萧城”为正方形，南北2、5里，东西2、5里，周围正好10里，城墙高三丈，至今四门俱存，内有南、北二将台。
公元1004年，王沿去世。王沿（？-1044）字圣源，大名府馆陶人。天圣年间（1023-1032）考中进士，他曾建议修渠屯田，并亲自策划实施修复相、魏、磁、洺等地十二渠，上奏皇帝建议罢黜牧监，使民生经济得到恢复和发展。
公元1048年（北宋庆历八年）六月，黄河在澶州（今濮阳）商胡埽北决，宋人称为“北流”，其基本走向从今内黄、南乐、大名、馆陶、邱县、临西、威县、南宫、青县在天津入海，在馆陶境内基本是今西沙河。
公元1059年，王安石出使辽国。王安石（1021年-1086），字介甫，号半山，封荆国公。有《王临川集》、《临川集拾遗》等存世。他出使辽国的时候，曾在馆陶经过，写下了著名的《发馆陶》、《永济道中》等诗篇。
公元1093年（元佑八年），宗泽被派往大名府馆陶县任县尉兼摄县令职事。宗泽到任不到一个月，就迅速而妥善地处理完该县历年诉讼积案，显露了他处理政务的才能，赢得了属吏们的信任和敬仰。绍圣二年（1095）知府吕惠卿命宗泽巡视御河修建工程，这时宗泽适丧长子，他强忍悲痛，奉檄即行，史称“国而忘家”。
公元1100年（宋徽宗二年）前漳水在馆陶县经过。自隋至宋，漳河在馆陶的流经路线大致沿今沙东干渠上游、蔡口渠、卫西干渠下端宋尔庄进入临西县。
公元1189年（金世宋大定二十九年、宋孝宗淳熙十六年），馆陶县属河北西路大名府。在金统治期间，馆陶县城从原馆陶城（南馆陶）迁移到今北馆陶镇。
公元1266年（元世祖至元三年），馆陶县属山东省濮州路。元初在全国设行中书省，下设路、州、县，馆陶县初袭金，属山东省东平路。
公元1300年(元大德四年),为解决自金代黄河夺淮以后御河水量不足、影响漕运的问题，由临漳分漳水一支，经成安、广平至馆陶县孙庄村南入御河，增大了御河水量。
公元1324年（元泰定帝也孙铁木耳泰定元年）九月，濮州馆陶县发生水灾，都水监遣官督丁夫五千八百余人修治“御河”（元代以后“御河”成为了原永济渠的专有名词），至十月二日完工。
公元1368年-1417年，明初的移民历三朝50年。《明史》、《明实录》记载的十八次移民中，往山东省西北馆陶一带移民就有四次。
公元1369年（明洪武二年）七月，馆陶改属山东省东昌府。
公元1400年11月，燕王朱棣“移屯馆陶”。“靖难之役”中，他曾先后四次从馆陶桥过河，其中有三次在馆陶县屯兵驻扎。
公元1467年（明成化三年）三月，知县唐祯主持修筑县城竣工。新城周围五里，城高二丈五尺，厚二丈，城外有池即护城河，深三丈，宽三丈，建有四门，东门叫“丰乐门”，南门叫“明远门”，西门叫“临津门”，北门叫“建都门”。
公元1489年（弘治二年），升临清为州，馆陶县改属临清州，直到明末。
公元1573年，河北栾城人李重奎任馆陶知县，政余修志，纂成《新修馆陶县志》4卷，于1574年（万历二年）刊行。这是目前所能见到的最早的馆陶县志。
公元1589年（咸丰九年）清政府在馆陶县设厘卡（址在今北馆陶镇西南2公里处），由省派员经营。
公元1631年（崇祯四年），晋调元被任命为馆陶令。晋调元，字淑君，陕西长安（今西安）人。时值荒年，馆陶县百姓生活无着，很多人纷纷出外逃荒。晋调元捐俸煮粥赈灾，不少人赖以存活。死后，百姓感其恩义，建祠祭祀。
公元1644年（崇祯十七年），明朝政府在馆陶建水运站、递运所。二月，闯王李自成及其大将李芳亮来到鲁西一带，在临清、馆陶、高唐、成安等地活动，并于三月在馆陶设置政权管理机构，任程文焕为县令。
公元1667年，湖北潜江人郑先民任馆陶县令，为治严明，弊绝风清，待人以诚。他主持修学宫、纂“邑志”（即县志），政绩颇多，有《卫水秋涨》、《萧城晓烟》等吟咏“馆陶八景”的诗歌存世。
公元1713年（康熙五十二年）三月，馆陶县人李珍授登仁郎，仁至四品京官。李珍，馆陶县东厂村人，他体魄魁伟，性格朴忠。康熙循卫河出巡曾到馆陶，见他后十分赏识，予以提拔重用。
公元1725年（雍正三年），分漳资卫，以利漕运。县内行政区域以卫河流经进行划分，南自迁堤，北至尖冢，沿岸共设铺舍十二。
公元1764年，张问陶出生于馆陶。张问陶（1764－1814）字仲冶，号船山。官至山东莱州知府。他以诗知名,是清代蜀中诗人之冠。他对馆陶有很深的感情，其诗《咏怀旧游》写到：“虮虱生来亦帝臣，陶山常恐是前身。”
公元1776年（乾隆四十一年），馆陶属东昌府，辖四区二十七图四百九十七个自然村。
公元1825年，江苏阳湖人张琦任馆陶县令。他善断狱情，各类案件极少；他创办了惠民局，为病者诊治，解除了不少病人的苦痛。张琦周密地计算原河沟堤防并尝试用区田法解决卫运河泛滥成灾的问题。张琦少工文学，有《〈战国策〉释地》、《宛林文集》等著作传世。
公元1859年（咸丰9年），在馆陶县西街设厘卡，派专人掌管漕运，此后还先后在馆陶设水马站、递运所，负责水运事务。
公元1871年（同治十年）仓尔爽任馆陶知县。仓尔爽，字隽臣，河南中牟县人。他在馆陶城（今北馆陶镇）东北汪堤村附近修建水闸一座，治理水患，百姓称此闸为“仓公闸”，并建碑记事以颂其德。后又修文庙，办学校，清狱案，惠政颇多。
