在《永署岛二期填海工程畅想》一文，永署岛规划不是很理想，湖留的太小，10米左右的深水区填的太多（见下图），西边水深不足5米的水域没有利用。

为充分利用沙土资源，填出更多的土地，对永署岛二期填海工程规划做了调整（见下图），中间深水区围湖面积由2.37平方公里扩大到3.96平方公里，节省大沙子用于填北边水深5米以内的浅水区（图中绿色部分）。按新规划完成二期工程，永署岛面积将达到23.66平方公里，其中土地面积19.5平方公里，比调整前增加3.24平方公里；湖泊面积4.16平方公里，比调整前增加1.59平方公里。军事基地用地（蓝色、浅蓝色部分）约13.82平方公里，城镇和农庄用地（绿色部分）约5.68平方公里。