修昔底德回到雅典之后多久才死呢？死在什么地方？怎样死的？葬在什么地方？关于这些问题，众说纷纭。波桑尼阿斯说：“修昔底德在归国途中遇刺身死。” [ 注：波桑尼阿斯，I．23．9。 ] 这个说法显然是错误的，因为从他的著作的修改情况来看，他一定是回到雅典，经过一个短时期之后才死的，在上面已经说过，修昔底德提到雅典和比雷埃夫斯城墙的被拆毁。他在晚年至少有一部分时间是住在色雷斯，因为在他的著作中他提到安菲玻里城塞建筑的改变。传说他晚年住在马其顿王阿基拉斯的宫廷里，并且死在马其顿；这是因为他在他的著作中对于阿基拉斯有详细的叙述而引起的推测。但是他既住在安菲玻里附近，这些事情不是一定要住在马其顿宫廷里才能知道的。所以这个传说是不可靠的。
关于修昔底德死亡的地点，马赛林那斯的说法前后也不一致。他时而说，修昔底德死于色雷斯， [ 注：贝克，I．39，8和I．1．9。 ] 又说，他死在他流亡时所居的地方， [ 注：贝克，I．5．6。 ] 意思也是指色雷斯；但是他又说：根据狄狄马斯从琐皮罗斯那里得来的消息，修昔底德从放逐归来后，在雅典遇刺身死。 [ 注：贝克，I．15．6。 ] 至于泰米阿斯说修昔底德死在意大利，并且埋葬在那里的说法，他认为是不正确的。 [ 注：贝克，I．25．6。 ] 普鲁塔克说，修昔底德死于色雷斯的斯加普特－亥尔。大体上说来，修昔底德死于色雷斯一说是比较可靠的。
古代的作家，如波桑尼阿斯、普鲁塔克、马赛林那斯等都说他是遇刺身死的，这个传说大概是因为他的著作突然中止而猜想出来的。
所有古代的作家都没有说到他死亡的确实年代。从他的著作中可以推想他在回雅典之后不久就死亡了。在他的著作中，他所提到公元前404年以后的事情是马其顿王阿基拉斯的改革，阿基拉斯死于公元前399年。修昔底德的死亡可能在公元前399年之后不久，至迟不会过公元前396年，因为那一年以后发生的事情他完全不知道了。例如他提到公元前425年埃特纳火山爆发的时候说，“这是五十年以来第一次火山爆发”，这证明他不知道公元前395年所发生的一次火山爆发。 [ 注：这次火山爆发，见戴奥多鲁斯，XIV．49。 ] 公元前393年雅典人在科浓领导之下，恢复海军势力，重筑雅典城墙的事，他也不知道。如果他出生于公元前455年，而死于公元前399年或396年的话，他的寿年是五十五岁或五十八岁，这和马赛林那斯说他死时年五十多岁的说法是相符合的。
他死后埋葬在什么地方，这也是一个没有弄清的问题。许多古代作家肯定地说他是葬在雅典。普鲁塔克说他葬在赛蒙家族的墓地里，前面已经说到了。波桑尼阿斯也说，他在回雅典途中遇刺，“他的坟墓在离麦利提亚门不远的地方”。 [ 注：波桑尼阿斯，I．23．9。 ] 马赛林那斯也说：“所谓赛蒙家族的墓地是在科伊利的麦利提亚门附近，希罗多德和修昔底德的坟墓也在那里。” [ 注：贝克，I．30．3。 ] 因此他得出修昔底德和赛蒙有亲属关系的结论。但是史学家希罗多德是死在南意的条立爱，并且葬在那里的，为什么他的坟墓又到了这里呢？在另外一个地方，马赛林那斯又说：“有些人说他死在他流放的地方，他在雅典的坟墓只是一个衣冠墓，”“因为墓上有一个桅杆，这是习惯上那些不幸死于海外，而没有埋葬在雅典的人的衣冠墓的标识。” [ 注：贝克，I．5．6。 ] 后来他在他写的传记上又很具体地谈到修昔底德的坟墓：“依照安替拉斯所说的，他的坟墓在城门附近亚狄迦一个叫做‘圣地’的地方；安替拉斯有丰富的历史知识，而且善于解释历史，所以是一个可信的见证人。他说，‘圣地’上有一个石柱，柱上有这样的铭刻：‘奥罗拉斯的儿子修昔底德，阿利摩斯得莫人。’有些人还在后面加了几个字：‘安葬于此。’但是我们说，这些添加的字样是捏造的和窜改的，因为铭刻上并没有‘安葬’等字样。” [ 注：贝克，I．18．11。 ]
从上面一些引证看来，我们知道，关于修昔底德的葬地的传说是多么纷歧。上述的一个传说说到修昔底德有这样的一个坟墓在雅典，似乎证据很确实，所以有些权威学者也信以为真了。但是仔细研究起来，这个证据是很不可靠的，事实上都出自一个来源，而这个来源是可疑的。这些作家都是从公元前二世纪地理学家波利蒙的著作《雅典卫城的周围》一书中得到他们的资料，马赛林那斯曾两次引用这本书 [ 注：贝克，I．2．4；I．33．5。 ] ：第一次引用这本书作为证据，说明修昔底德的坟墓是在麦利提亚门附近的“圣地”，和赛蒙家族的坟墓在一起；第二次是提到有许多历史上知名的人的名字都叫作修昔底德。所以麦利提亚门附近可能有一个名叫修昔底德的人的坟墓，但不一定是史学家修昔底德的坟墓。不错，雅典有一种风俗，为那些不幸淹死在海中的人所作的衣冠墓上有一个桅杆作为标识，但是这种风俗是修昔底德死后百年才有的，这是波利蒙时代的风俗，而不是修昔底德时代的风俗。所以修昔底德埋葬在雅典的说法是虚构的；他的坟墓究竟在那里，我们一点也不知道。
关于修昔底德的生平，我们所知道的只有上述的一些。关于他的传说大部分是不可靠的。
