理藩院是清王朝中央专门管理内外蒙古、青海、西藏、新疆及四川土司等地区少数民族事务的官署。我国清代历史档案中对其多有涉及。今据清代档案和史料辑成此文，旨在简单介绍该官署的沿革、职官、职掌等方面的情况，为利用有关档案者提供一些便利。
　　明末清初之际，清朝统治者在“崇德元年（1636年），设蒙古衙门，置承政、参政各官”。后因“蒙古部落尽来归附”，又于“崇德三年（1638年）定蒙古衙门为理藩院”，“专管外藩事务”。当时的职官“设承政一人，左参政一人，右参政一人，副理事官八人，启心郎一人”。到“顺治元年（1644年），改承政为尚书，参政为侍郎，改副理事官为员外郎”。又增加了员外郎、启心郎的名额，新设了堂主事等官职。在顺治“十六年（1659年），以礼部尚书衔掌理藩院事，以礼部侍郎衔协理理藩院事”。至十八年，因理藩院“专管外藩事务，责任重大，今作礼部所属，于旧制未合，嗣后不必兼礼部衔，仍称理藩院尚书、侍郎”。“凡官制体统，应与六部相同。理藩院尚书，照六部尚书入议政之列”。“理藩院尚书衔名，著列于工部之后”。雍正元年（1723年）后，“以王、公、大学士兼理藩院事”。在顺治至康熙年间，还建立调整了各内部组织来分司其事，增添充实了官吏以各任其职。到清朝中叶，这一管理外藩的机构已逐渐地健全起来。

　　1、旗籍清吏司。官设“郎中，满洲一人，蒙古二人；员外郎，宗室一人，满洲一人，蒙古二人；主事，满洲一人”；笔帖式，“满洲五人，蒙古十人”。职“掌考内扎萨克之疆理，叙其封爵，与其谱系。凡官属、部众、会盟、军旅、邮传之事皆掌之。掌游牧之内属者”。
　　2、王会清吏司。官设“郎中，满洲一人，蒙古二人；员外郎，满洲二人，蒙古三人；主事，蒙古二人”；笔帖式，“满洲三人，蒙古八人”。职“掌颁禄于内扎萨克，而治其朝贡、燕飨、赉予之事”。
　　3、典属清吏司。官设“郎中，满洲一人，蒙古一人；员外郎，满洲二人，蒙古六人；主事，满洲一人，蒙古一人”；笔帖式，“满洲四人，蒙古六人”。职“掌核外扎萨克部旗之事。治其邮驿。互市则颁其禁令。凡内外之喇嘛皆掌之。掌游牧之内属者”。
　　4、柔远清吏司。官设“郎中，宗室一人；员外郎，满洲二人，蒙古五人；主事，蒙古一人”；笔帖式，“满洲二人，蒙古九人”。职“掌外扎萨克、喇嘛禄廪、朝贡之事”。
　　5、徕远清吏司。官设“郎中，蒙古一人；员外郎，满洲二人，蒙古三人；主事，蒙古二人”；笔帖式，“满洲三人，蒙古五人”。职“掌回部扎萨克之政令，凡回、番之年班皆掌之。掌外裔之朝贡。”
　　6、理刑清吏司。官设“郎中，蒙古二人；员外郎，满洲二人，蒙古四人；主事，蒙古一人”；笔帖式，“满洲二人，蒙古五人”。职“掌外藩各部刑罚之事”。