友人：米琪找到一个电梯，但是突然发生了地震（剧情后面会说，是依托卡的梦在重构世界）掉到了楼下。反复利用吸尘器找到一些物品后终于攥着绳子（先要打开上面的电梯门，绳子会落下来）攀了回去。剧情，回去时跳一断桥险些掉下去，这时库洛爱伸出援手，米琪平安无事。
死：少女们晚上睡觉时又发生了地震，依托卡掉到一地洞中到了垃圾槽中，阿斯纳去救她。先找到钥匙打开电梯门，然后中间的闸门降下，和依托卡对话后把墙上的灯全部点成蓝色，方法从左到右按开关前3个按一下，第4个按两下。剧情，依托卡和阿斯纳谈心。
红茶:奥尔卡寻找水源找到一个公园，在自动售货机买了一罐红茶在长椅上喝了起来，回忆起给父亲泡红茶的情景。泡茶，放茶的抽屉密码735，按说明泡好茶，然后开茶箱，有两层，先调整前面的十字滑块，找到背面开关的位置，十字上图样正确并点击开关解锁开关位置分别在背面九宫格的第2格和第5格（正中）。方法看图

道：大家去控制室开大门时，库洛爱在电脑前回忆起了和橙子的相遇。逻辑象棋，第一局，按power的顺序：92（1）433571（2），第二局：4734。
足：岩浆流入了通道内部，米琪和大家跑散了。找到pda和记忆卡按说明扳控制台的摇杆，用消防装置冷却岩浆后，米琪逃离了火场。
宝物：少女们经过发电站时，阿斯纳找到了自己在父亲生日时给他的项链。看数表得到密码，顺着箭头看：箭头调到左下，数字调到d2、a9，然后扳动摇杆得到项链。
龟裂：从员工通道来到废弃的车站，奥尔卡和大家发生了分歧。库洛爱带着大家到冷冻室搬食物，实际上是找mark。
名前：少女们到热水房洗澡，库洛爱回忆自己得到第一个mark，并确定下一个就在热水房内。经过尝试，连好水管后洗澡，在炉子中找到mark。
目觉：依托卡做了梦后醒来，发现自己在旅馆的大厅中。首先梦到奥尔卡帮阿斯纳找药品时的情景，把数字键盘拼成九宫图。

稚草：一路上大家为了路线的选择展开讨论，依托卡一个人到公园散心，躺在长椅上睡着了。打开茶箱得到香茶粉，顺着被风吹走的香茶粉依托卡发现了一朵独自绽放的白色小花。茶箱的拼图：

感染：少女们找到一个可以落脚的旅馆，但体内的纳米机器人却意外感染了叫伏里奥的电脑病毒，奥尔卡、米琪和阿斯纳被隔离。先接通房间电源，打开电脑，看找到的纸条并对照电脑键盘，发现每一排的六个字母刚好在键盘上圈出一个字母，得到密码。把房间的门把手拆了，然后用放大镜调查，用电脑搜出两张数表，计算出密码，答案9236。奥尔卡开门后看见库洛爱倒在地上。
（提示：
首先把门锁用螺丝刀拧下,上面会有生产编号.然后在电脑里调查编号得到两个文件.调查文件可得到检查结果1和检查结果2.
检查结果1是一张数表.
检查结果2是■■■■-■■.
检查结果2提示密码是四位减去二位的组合,这在检查结果1中刚好是第3排的"4852-71",接下来做个减法得到数字4781.要逆向思考的是这个密码是在门外开门的时候使用的.因为房间看到的是锁内部的情况,一个圆10等分依次是数字0-9，这样数字5外面看就是0，对应的每位比5大就减5，比5小就加5.密码锁要让4出现在门外,从门外看是4锁内看就是是9.密码4781调换到锁内看就是9236,因为站在房间内,所以方向也是倒的,需要从右往左输入.）

救：阿斯纳在房间里回忆起了和惠香的在一起时的事。计算机教室，调查抽屉得学生卡一张，调查01号阿斯纳的储物柜，掏卡开之，得数表一张，再打开20号惠香的储物柜，得班级学号，调查课程表惠香告诉阿斯纳今天是7月14日周五，看便条推出6月28是周三，调查13号班长的储物柜，密码1326，打开得到教师储物柜的钥匙。看便条推出教师储物柜密码1462，开之得教师卡一张，开门走人。然后阿斯纳和惠香去取有惠香照片的记忆卡。回过神来，阿斯纳不知不觉中对依托卡产生了感情。
（提示：1、阿斯卡的学号是01，密码0102，穗香的学号是20，密码是2040，规律是学号乘以2，然后连起来。班长的学号是13，所以密码是1326;
2、首先7月14日周五,6月15号周四，电脑课，密码是1569；6月28号周三，家庭课的密码是2835。可见教师密码的前两位就是当天的日期号，第三位是指第几节课，四位是科目对应表里的数字。比如6月15日上周四的课，信息课是第6节课，第3位就是6，那么第4位再找当天电脑课在对应表上的数字就是9，6月28日的家庭课同理。于是7月14日周五最后一节课，密码就是1462）

Six：阿斯纳和库洛爱和大家分开行动。两人到了一个大厅，先把柜子立起来，在地下室墙上得到大厅左边柜子密码763，从通风口进去。Lv3的图书馆，就是模拟文件的压缩与解压，用2个正方形、2个矩形和1个凹形拼图。阿斯纳退出后，发现库洛爱已经死在程序中，后面有库洛爱的剧情就不能玩了。
闭锁：E13区域，房间发生了火灾。用自动灭火装置灭火，调查抽屉得到数表一张，大门密码从数表可知第一列和第五列是5个全按，然中间一列是0不要按，数表左边是左右各要按几个，可以把左下角设为原点：（1，n）（2，1、3）（4，1、2、3）（5，n）。掉队的依托卡被困在里面，先玩闭锁依托卡会敲门，然后安全的出来。先玩翼再玩闭锁阿斯纳回去救依托卡，救出后绊到脚被浓烟窒息。门的开关，有3种方法：从上到下4个空格标为1~4。1）3蓝4蓝1红2蓝， 2）2蓝1蓝/4红3蓝。

伪：奥尔卡和米琪、库洛爱找到了主电梯。主电梯，开关内两圈外彩灯的颜色调为一致，上到一个大厅，按左侧墙上显示的标记按好地上的开关，打开大门进入一个植物园。岩浆流入，奥尔卡脚被绊了一下，牺牲自己救了米琪和库洛爱，先玩six就没有救库洛爱的剧情了。
事故:依托卡的一个梦把米琪消失了。控制室，房间里隐藏的每个数字点一下。列车中，调查找到3张纸片，看左边沙发找到的纸片
和路线图，装钥匙的红箱密码5187。刹车把摇杆扳到右边，数字键除了4和7都按一下。
（提示：在火车的那些座位上，能够看到一张卡，卡上有两个站名，作为出发站和终点站，对照的那个门上的列车线路图，可以得到，一共跨越了4站，这4站上对应的时间分别是5分钟，1分钟，8分钟，7分钟）

手术：奥尔卡给阿斯纳取子弹时停电。熔炉中，把灯全部调成蓝色，完成后米琪防火服损坏牺牲。阀门控制主管道通气量百分比，小阀门的百分比是通到上面管道的量。先调主阀2、3尝试求出灯4蓝色时值为288，然后依次试出1~3的数字，完成图：

启示：库洛爱调查依托卡的来历。依托卡dead。扫雷，从外围向中间扫，解两角的开关，格子中的零件不能在一行一列或者与对角线平行的直线上（国际象棋皇后问题，雷顿小镇也有，二代还有骑士旅行问题）。如图：

全路线图
序章 第一幕 第二幕 第三幕 第四幕 第五幕 第六幕 终章
ミキ 胎動 血 友人 足 宿主 偽り 犠牲 羽
アスナ 霊 死 宝物 救い SIX 思い ループ
オルガ 父親 紅茶 亀裂 感染 閉鎖 手術 封印
クロエ 数字 道 名前 凶兆 翼 啓示 永遠
イトカ 夢 目覚め 雑草 覚醒 事故 ZERO 地上
隐藏关的路线：
感染-觉醒-凶兆-闭锁-翼-伪-牺牲-启示-羽
-伪-six-思-穿越
-启示-牺牲-手术-封印
感染-凶兆-翼-牺牲-启示-永远
感染-觉醒-凶兆-翼-six-闭锁-伪-事故-zero-地上

穿越：阿斯纳进到依托卡的梦中。一番探索后看右边墙的配线和第二格的铁板，控制室密码6359。阿斯纳线完成。
（提示：球和轮子合出的透明轮子，可以看到图案由2个三角形，1个正方形，3个六边形组成，把屏幕上留下这些图形（位置任意）其他点掉就行了，然后右边墙上的第二块铁板可以取下来了，在用透明球和铁板合成一下嵌到墙上可以看到数字，然后把电路走一下获得密码。工地那里最后的配重是3块石子加衣服和铲子。）

永远：库洛爱和米琪来到图书馆。按纸条排列好，按顺序翻书，蓝192、红825、黄230/264、蓝132、绿341找到一张纸条，白1/751（此页阅读后才能点击黑色地板）得到一张纸条、红937，黑329（阅读暗号后才能调查九号书架），九号书架找到一本书。电梯密码，先把按键全部点一遍不发光的部分是密码724E。库洛爱线完成。
（提示：
1、手推车上5本书和一张卡。
2、点击书架IV，R键切换视角到书架III架子右二调查那个空隙，卡上说是从左到右从低到高，排好，绿黄白蓝红。
3、退出书架，点击书架II，L切换视角到书架III，看到一本书背上写着PAGE192，对面是刚排好的书的蓝色那本。
4、打开蓝色192页，提示打开528-DER页。
5、打开红色825页，看的一个显示2：30的黄色的表。
6、打开黄色230页，看到132（蓝）→264（黄）。
7、打开蓝色132页，看到上下颠倒的GREEN。打开黄色264页，看到715和上下颠倒的341。

Zero：橙子和依托卡的相遇。密码wmbhf。
（提示：真单词是wmbhf，炸弹单词是依托卡jitka
规则基本上是和「ヒット＆ブロー」や「マスターマインド」之类的游戏一样。（日本一种小游戏）
根据提示猜单词的游戏，规则如下，要注意的是，还有一个炸弹单词（假单词）
比较结果（颜色鳟鱼和炸弹）只表示数量。和显示的位置没有关系。
红：输入的密码5个字里面，字母和位置都对的数量。
黄：输入的密码里，字母是对的但位置不对的数量。
爆弹：输入密码里，假文字的数量（不论顺序，输入5个假文字即判定失败）。
蓝：无关字母（既不是真单词也不是假单词）的数量。 ）

地上：依托卡让地面再生，少女们终于从量子世界回到地面。库洛爱见到Deepsort前的两个问题，如图。
（提示：线代表开关控制的格子，蓝色是加减，橙色是乘除，用得到数字的前一位与后一位做四则运算，然后完成这个类似数独的填空 ）