高等教育，一直被视为深圳发展的“短板”，经济体量在中国名列前茅的深圳，高等教育却一直与经济发展的耀眼成绩单和城市地位难以匹配。作为我市第一份针对高等教育全面发展制定的文件，《高教意见》提出坚持以打造高水平学科为基础，较大规模高校和特色学院建设并举，普通高等教育和职业高等教育同步推进，经过10年左右努力，建立国际化开放式创新型高等教育体系，建设成为南方重要的高等教育中心。
市教育局副局长许建领介绍，《高教意见》不仅明确了我市高等教育未来10年发展的总体思路和目标，
而且在高校数量、高水平大学数量以及高水平学科数量等方面明确了分步走的时间表、路线图。到2020年，高校达到18所左右，在校生达到20万人，其中全日制在校生15万人，研究生比例进一步提高，5－6所高校纳入广东省高水平大学建设计划；到2025年，高校达到20所左右，在校生达到25万人，其中全日制在校生20万人，研究生规模约4万人，3-5所高校综合排名进入全国前50名。在学科建设方面，到2020年，力争进入教育部学科评估前10%的学科达到25个以上，进入世界ESI（基本科学指标数据库）排名前1%的学科达到15个以上；到2025年，进入教育部学科评估前10%、世界ESI排名前1%的学科，分别达到50个和30个以上。