提高脱硝脱硫效率是根据原设备的反应原理来确定，就常用的SCR脱硝和石灰石湿法脱硫来说，脱硝效率取决于催化剂、还原剂和反应环境，可以设置足够的催化剂（足够是因为到了一定数量后再增加也不会提高效率），或者增加还原剂量也就是氨（喷氨量太多也会造成堵塞腐蚀等问题），提高还原温度（温度区间必须在催化剂最佳效率范围）等方法；而提高脱硫效率最直接的方法就是增加石灰石浆液量（连带浆液泵厂用电量增加）、优化喷淋层布置或烟气流等等。但是上述方法有可能影响机组经济性或稳定性，因此提高优化效率需要综合评估，取最佳方式。