近年来，苹果根部问题越来越严重，很多果农反映，施了不少氮钾肥，但苹果个头长不大，而且表光也不好；
有的发生黑点、痘斑，有的果面粗糙、果锈严重，有的树体表面正常，扒根检查发现，许多毛细根发黑、发红或者病根和烂根。
苹果根系在土温3℃时开始生长，7℃以上生长加快，20～24℃最适于根系生长。土壤相对湿度60%～80％、含氧量10%～15％、土壤pH值6.5～7.0时根系生长活跃。条件不适宜时，果树常发生红根、黑根、烂根等病根现象。
果实大小、表光和品质好坏都决定于苹果根系是否健壮。根系发生黑根、红根和病烂根等较轻时会引起树势衰弱，表现出果个偏小、果锈、黑点痘斑、果面粗糙等症状。苹果黑根、红根、病烂根较重时不但产量和品质下降，而且导致苹果整株衰退死亡。
1、引起红根、黑根、烂果的主要原因
1.1水涝
主要是由果园积水后根部缺氧窒息引起。发生水涝烂根后，树势衰弱，叶小而薄，常出现各种缺素症。扒土刨出根系检查，吸收根多数变褐死亡，主根褐色腐朽，有一种酸腐气味。
1.2低温冻害
多是主干木质部受冻，造成水分输导困难引起烂根、黑根等。果树受冻后，地上部表现为发芽较晚，叶片较小。
1.3化肥施用不当发生肥害
将大量的化肥或高浓度化肥施在树根附近，造成根系受害。受害根吸收过量化肥后，经根颈部输送到主干、主枝和枝梢，使这些部位皮层变黑枯死，皮下木质部也变黑褐色。
后期枯死皮层下陷与健康皮层形成明显界限，并沿树干带状向上蔓延。一般只在1～2个主枝上发生。受害严重时，主根皮层变褐坏死，木质部发黑，小根和须根变红褐色而死亡。
1.4土壤酸化土壤
pH值小于5.5，土壤酸化严重，影响根系生长，造成红根、黑根及烂根。地上部枝条表现粗皮病等症状，果实表现果面粗糙，痘斑病、苦痘病、黑点病严重。
1.5根部病害
引起苹果黑根、红根及烂根的病害主要有：苹果白绢病、根朽病、圆斑根腐病、紫纹羽病和白纹羽病。典型症状表现如下。
苹果白绢病：主要发生在根颈部，也称“烂葫芦”，根部皮层腐烂后，有酒糟味。根颈有如白色丝绢状菌丝层覆盖，因而得名白绢病。
苹果根朽病：主要危害根颈、主根和较大侧根。发病的烂根具有浓厚的蘑菇气味。
圆斑根腐病：该病先从须根、细根开始发病，上生红褐色小圆斑，逐渐蔓延到侧根及大根，最后使全部根系腐烂死亡。
苹果白纹羽病：该病开始从细根、须根霉烂，随之扩展到侧根和主根。病根表面缠绕白色或灰白色的丝网状物。
苹果紫纹羽病：该病先从须根细根感病，渐次扩展到侧根和主根。病部表面缠绕许多疏松紫色的丝绒状物，形如羽毛，因此得名。
2、苹果黑根、红根、烂根的防治方法
2.1合理施肥，提倡增施生物有机肥
基肥提倡深翻开沟施肥法，氮、磷、钾按比例施用。经科学实验证明，微生物菌肥是土壤肥力组成的一 部分，氮肥、磷肥及有机肥等必须经过适宜种类的微生物活菌才能转化成果树可吸收利用的养分。
如果没有微生物活菌，向地下施用的氮磷钾等肥料再多也不起作用。微生物活菌通过占位、拮抗、分泌毒素等途径，能压低或杀死土壤中的许多有害病菌，对果树的根系起到很好的保护作用。
2.2及时缓解肥害
对发生肥害的果树，发现后要及时扒土，尽量挖出与根接触的肥料。
2.3做好果园排水
及时排除果园积水和过多水分，切忌积水涝根。对已涝根果树常用灌根和叶面喷液方法进行救治。
2.4中和土壤酸性
土壤偏酸的果园，结合施基肥，施用一定的补钙肥料。
2.5树干涂白防止树干及根茎部冻害
涂白配方：生石灰6 kg，加水18 L化开，然后加入0.3%食盐，以增加粘着性。根茎部适当培土也能有效预防冻害。
2.6及时有效防治根部病害
对白绢病，先将根茎部病斑用刀彻底刮除，用药液消毒，后涂抹果树愈合剂。
3、诱导促发新根是有效措施
3.1利用有益微生物活菌保护根系
增施生物有机肥能有效提高土壤中混合有益微生物活菌量，利用土壤中的多种有益微生物活菌保护果树根系不受病菌侵害。
3.2刺激和诱导促发新根的措施
果树根系如果没有毛细根，就无法吸收和利用养分，毛细根越发达，根系就越发达，吸收和利用的养分越多越全面，苹果的产量就越高，质量就越好。
根系发生黑根、红根和烂根往往先表现在毛细根上。可用相应灌根、壮根液进行刺激和诱导根系生长。