宗喀巴于《菩提道次第广论》的冠首,先说明自身和“空行母”、“空行佛母”的密不可分的关系,来作为伏笔;紧接著提到学人必须将“上师”当作是“佛”,又应该以“妻子”、“命根”,来奉献服侍自己的“三昧师”以示真心向道,并舍弃正统佛教的戒律,改以藏传佛教独设的“三昧耶戒”作为学密者的根本戒律,以及真正的依归之处。再来则以“一人”或“双修”乐空双运,明说世间人会觉得难以接受这两者之间的差异,然而藏传佛教的“智者”却能了解教法是有“开遮”上的不同;又说女阴“智慧”和男阳“方便”不可须臾分离,智慧明妃与方便勇父必须常常结合而“止观双运”,表示双身修法并不违背藏传佛教戒律。其中还有另一个清楚明白的指示:《菩提道次第广论》应以《密宗道次第广论》为依止,菩提道只是密宗道的前行准备的方便学习的功课。