腰椎椎管狭窄症和腰间盘突出症在症状上相似，同时二者往往同时存在。所以区分起来相对困难。
以下4点加以区分。
1、定义上区分 腰椎椎管狭窄症是由于先天性发育异常或后天因素（骨质增生、腰间盘突出、纤维组织增生、腰部创伤、腰部疾病等）引起的椎管或神经根管狭窄所引起的临床症状。腰间盘突出症是指腰间盘髓核向椎管突出，压迫神经根、硬膜囊、或马尾神经而引起腰痛、下肢放射性疼痛不适等临床症状。
2、症状上区分 腰椎椎管狭窄症疼痛多以下腰部疼痛为主，常伴有广泛的下肢疼痛，常累及腰骶部。当神经根管狭窄时，和腰间盘突出症的症状相似。并且有典型间歇性跛行症状。腰间盘突出症主要是腰背疼痛和下肢放射性痛。
3、体征上区分 腰间盘突出症直腿抬高实验通常为阳性。腰椎椎管狭窄症直腿抬高实验通常为阴性。
4、影像诊断上区分 腰椎管狭窄症影像上通常表现为椎管骨性结构增生、硬膜囊外脂肪增厚、椎间盘突出等多种原因引起的椎管狭窄。腰间盘突出症在影像上表现为腰间盘突出或脱出。
当然，有时腰椎管狭窄症和腰间盘突出症共存。