两支空军都继承了共同的历史遗产，有着共同的英雄——譬如，两边都有以一战头号王牌弗朗切斯科·巴拉卡为名的空军单位！还有，如1943年9月前的皇家空军一样，两边的飞行员和地勤人员都继续以可怜的装备及有限的后勤支援进行战斗。

在“停战”之际，由于英美空军的持续的压力，意大利空军剩余的大部分力量都集中在亚平宁半岛的中部和北部地区的基地。当“停战”一宣布，这样的地理分布使德军很容易地俘获了许多意大利飞机。在南方的许多空军由于缺乏任何装备而面临解散。

在北方，10月，空军副部长〔Sottosegretario all'Aviazione〕埃内斯托·波托〔Ernesto Botto〕中校和在意大利的德国空军〔第2航空队〕司令沃尔弗拉姆·冯·里希特霍芬元帅达成协议，建立一个临时的空军的核心。朱塞佩·拜隆〔Giuseppe Baylon〕中校成为空军部的代理部长，波托将新的空军命名为“共和国空军”〔Aeronautica Repubblicana〕，1944年6月又加上“国家”〔Nazionale〕。

新的空中力量面临的许多问题中最大的一个是如何处理与德国盟军的别扭的关系，后者仅把他们当做是提供劳力和资源的处于从属地位的伙伴。举一个例子，正当“共和国国家空军”努力组成并装备其独立的作战单位时，德军却征用了超过1000架的各类飞机。

这种窘境只是到了1943年底才得到改善，德国JG.77归还了一些马基C.205V，使第1战斗机大队得以成军。该单位的首次空战是1944年1月3日在都灵上空。

要点防御成为“共和国国家空军”的主要任务，第二支成立的部队是“蒙台富斯科”补充中队，装备菲亚特G.55战斗机，接着是4月成军的第2战斗机大队。当意大利制战斗机的供应不继后，这些单位转而装备1944年中由德国JG.53和JG.77提交的Bf-109G。

在此之前的4月底，第1战斗机大队从坎波福尔米多〔Campoformido〕转至雷焦·艾米里亚，6月底又移至维琴察的蒂埃内〔Thiene〕。此时第2战斗机大队也从米兰布雷索〔Bresso〕转至博洛尼亚，又转至阿维亚诺〔Aviano〕进行Bf-109的转换训练，完成后部署到在自由镇〔Villafranca〕的新基地

当11月所有的德国空军战斗机部队从意大利撤回德国以用于本土的防御时，第2战斗机大队继续进行战斗活动。12月，第1战斗机大队转往德国以进行Bf-109G的转换训练，回国正好赶上二战在意大利战场的最后一段日子。尽管对于庞大的盟军机群，拦截不起什么作用，但第1战斗机大队还是与敌交战，并付出人员和飞机的惨重损失。

1945年4月2日是第2战斗机大队的短暂历史中的最黑暗的一天。24架Bf-109从阿维亚诺和奥索波〔Osoppo〕起飞，3架因技术原因返航，其他的飞向加尔达湖并由此飞往布雷西亚的杰迪〔Ghedi〕。 在那儿，他们拦截了大编队的由第347战斗机中队的P-47D护航的B-25轰炸机。在一场一边倒的战斗中，意大利人蒙受了灾难性的损失，至少14架Bf-109被击落，6名飞行员阵亡，却没有击落1架敌机。

“共和国国家空军”的最后一次战斗机出动是在4月19日，2个大队都参加了。第1战斗机大队的飞行员声称击落了1架B-24，第2战斗机大队则出动了全部的26架Bf-109试图拦截1个“米切尔”编队，但被护航的P-51D战斗机阻击，损失5架却没能甚至接近轰炸机群。

北方德国控制下的空军称为“共和国国家空军〔ANR〕”，在努力争取独立地位的同时，采用了德国空军的模式。“共和国国家空军”中纳入了伞兵和防空炮兵，并采用德国的战术编队〔双机/四机编队〕以及雷达引导和改进了的空对空射击训练。

还有，“共和国国家空军”沿用德国空军的大队样式重组了战斗机大队〔Gruppi Caccia〕，下辖3个战斗机中队和1个地勤中队。每个中队〔Squadriglie〕的战斗机数量增加到15—20架，与德国空军的中队〔Staffel〕相同， 而原来的意大利皇家空军每中队平均仅有10—12架。鱼雷轰炸机和运输机部队也根据能够得到的飞机数量得到重建。

由于南方的“意大利同盟空军”主要用于对地支援，因此2支空军中只有“共和国国家空军”中产生了战斗机王牌。下面列出的主要以非官方的资料为依据〔证实的战绩可能低一些，另外没有包括1943年9月前的战绩〕：

马里奥·贝拉刚比〔Mario Bellagambi〕少校，第2战斗机大队，11架〔另有说10架〕；乌戈·德拉戈〔Ugo Drago〕上尉，第2战斗机大队，11架〔另有说9架〕；阿德里亚诺·维斯孔蒂〔Adriano Visconti〕少校，第1战斗机大队，7架〔另有说5架〕；卡罗·库齐〔Carlo Cucchi〕少尉，第1战斗机大队，5架；乔万尼·萨耶瓦〔Giovanni Sajeva〕少尉，第1战斗机大队，5架；阿蒂里奥·桑松〔Attilio Sanson〕军士长，第2战斗机大队，5架。