(一)保护区内违法建设朴语山居等旅游项目。朴语山居和夹缝岩旅游项目于2018年5月5日由独山县城镇规划委员会2018年第二次会议评审通过,其中朴语山居项目全部位于保护区核心区,2018年5月1日建成营业;夹缝岩旅游项目位于保护区实验区,未办理相关审批手续,2019年6月峡谷激情漂流部分建成营业。凌霄阁观景台项目位于保护区缓冲区内,2017年4月开工建设,2018年5月完成主体框架建设后停建至今。净心谷旅游区《总体规划》和《修建性详细规划》(一期)由独山县城乡规划委员会分别于2015年8月14日第三次会议、2016年4月27日第三次会议评审通过,其已建成旅游水坝等项目与保护区缓冲区重叠(面积212亩)。
(二)保护区内生态环境破坏问题突出。三独高速公路穿越保护区段在施工过程中未执行环评批复要求,在保护区内设置了8个施工营地、3个拌合站、4个钢筋预制场、3个渣料场。检查发现,该项目在施工建设过程中,毁林开山、尘土飞扬、渣土乱堆、水道堵塞等问题突出;夹缝岩漂流项目在未办理环评审批等手续的情况下,违法建设,野