长期从事中医外科的教学、科研、临床工作,对血管病、乳房病和部分癌症的治疗有良的疗效,对中医外科基本理论及中医文献研究有较深的造诣。其主要学术思想体现在如下著作中:《中医外科心得集》初步总结了作者的实践经验,详细考证阐述了五善七恶的源流及应用,首次提出了与内治法相呼应的中医外科外治箍围消散法、透脓祛腐法、生肌收口法三大法,是中医外科学理论和实践上的重大突破;《中医外科外治法》明确提出了与外科外治的五法、十剂说,丰富了外科治疗经验,可操作性强,填补了中医外科外治法缺乏专著的空白;《中医外科方剂学》内服消、托、补,外用箍、祛、收,法度森然,249方一以贯之。真正使外科方剂由经验走向科学。此外尚有《中医外科学》(光明日报出版社)、《中医血管外科学》、《张子琳医疗经验选辑》、《乳房病》等共计30余部约合370万言著作行世。