以太丢了老家,一帮流浪民科老头子一路逃一路拉各种外星人用民用科技改造想造一批完美战士打回老家。终于找到完美种族人类但是派出的改造战士们被打得满地找牙,丢了自己的地下秘密基地,奇袭人类秘密指挥部又被击退(这里是if分支的地方)人类还反过来用以太的科技把自己武装到了牙齿,反手打掉了以太的移动指挥所迫使以太亲自上场对抗,最后一群人类战士们由一名最强的灵能战士带领突破了以太总部母舰的灵能锁,一路打到了以太首领面前击杀了以太首领和手下,其他人撤离,灵能战士自我牺牲把即将自爆的母舰拉出地球的引力圈后母舰自爆了,外星人的入侵结束了。
但是2代采用了基地防守失败的if线,人类的科技刚开始激光和轻甲就被装备精良的外星人骑脸冲了老家,原因是某国恐慌爆了投了外星人。