我们肠道中生活着成百上千种微生物，不同微生物喜欢不同的食物以满足其生长需求，有的喜欢吃肉，有的喜欢吃素，有的爱吃糖，有的爱吃纤维...不同的微生物为了能让自己得以生存，会释放出一种信号分子传递到我们大脑，告诉我们大脑它想吃什么了，让大脑作出选择去寻找它们爱吃的食物。
肠道微生物确实可以控制我们的饮食行为和食欲。实际上，在人类食欲调节和控制中，肠道微生物组在某些方面可能比大脑更重要。

当我们摄入不健康的饮食和/或接触其它一些可能导致肠道菌群紊乱的因素（eg:抗生素使用、接触病原体、心理压力、久坐不动、睡眠不充足等）时，肠道中的有害微生物会大量繁殖，它们所产生的一些有害物质可能通过脑肠轴转运到大脑，从而刺激大脑对高脂高糖等不健康饮食的渴望，形成一种微生物调节的食欲紊乱的恶性循环。相反，健康的饮食以及其它有助于肠道菌群平衡的因素（eg:接触有益微生物、运动、高质量的睡眠、多多接触大自然等），可以促进肠道中友好细菌的生长繁殖，它们所产生的物质会对大脑形成一种友好的刺激，更好的控制我们食欲，让我们对健康的食物充满渴望，而形成一种微生物调节的食欲控制的良性循环。
因此，我们的口味偏好和食欲是可塑的。如果改变他的饮食，他大脑中的奖赏中心和食欲中心将受到影响，使他的口味偏好和饮食行为发生变化，这些影响部分就是通过肠道菌群来调节的。相反，一个饮食几乎完全健康和吃健康食品的人，如果将饮食改为不太健康的食物和/或以其它方式破坏生活在肠道中的友好细菌，最终也会对各种炎症性食物产生胃口。这可能导致他体重增加、生病和抑郁。当然，肠道菌群紊乱并不是在这里发挥作用的唯一因素，然而，它可能是最重要的一个。
许多经常吃加工食品的人可能一时半会不太愿意转变为一种更加健康的营养饮食方案，部分原因是他们认为这样做会剥夺他们许多快乐并使他们的生活变得更加乏味。从根本上说，他们看重的是加工食品摄入所带来的短暂快乐，而不是坚持健康饮食所带来的更长久益处。
很多人不太愿意坚持健康的饮食方案，因为他们非常喜欢某些的“垃圾食品”，要他们放弃或严格限制这些食物的摄入几乎是无法忍受的。他们大多数人都没有意识到，随着人们选择健康的饮食，他们对垃圾食品的渴望也会随着时间的推移变得不那么严重，有时，甚至会完全消失。
当然，要想在全球范围内扭转这种局面似乎是很困难的，因为高度加工的食品显然已成为我们生活中无处不在的一部分。我们可以做的是尽可能的多选择那些健康的饮食，而尽可能避免那些高度加工的不健康食物，面对美食的诱惑，还应多考虑考虑肠道微生物的感受。