缺粮是一大原因
打仗打起来，春夏几个月下来
一年的收成就没了
三国战争波及全国
没人耕地，自然要饿死人的
魏书曰：“诸军并起，无终岁之计，饥则寇略，饱则弃余，瓦解流离，无敌自破者不可胜数”
军队都是如此，何况百姓呢

更大的可能是不见于史书记载的自然灾害，还有民众的逃亡。

恕楼某直言，两汉时期经济的大规模发展很可能在相当程度上是不合理的。其对生态环境造成的严重破坏可能是导致两汉末年大规模动乱的直接原因。就楼某所知，学术界至今尚无可靠研究。典型的例子是华北平原的农业过度发展、人口暴涨造成与两汉黄河水患（特别是西汉中后期）的关系。相关史料散见于《汉书·沟洫志》《后汉书·明帝纪》《后汉书·循吏列传·王景》。

自然灾害

建和元年春正月辛亥朔，日有食之。......二月，荆扬二州人多饿死......夏四月庚寅，京师地震。......郡国六地裂，水涌井溢。......九月丁卯，京师地震。......清河刘文反，杀国相射皓，欲立清河王蒜为天子；事觉伏诛......前太尉李固、杜乔皆下狱死。......陈留盗贼李坚自称皇帝，伏诛。......白马羌寇广汉属国，杀长吏......秋七月，京师大水。......冬十月，长平陈景自号“黄帝子”，署置官属，又南顿管伯亦称“真人”，并图举兵，悉伏诛。......夏四月丁卯晦，日有食之......乙卯，震宪陵寝屋。秋七月庚申，廉县雨肉......京师大水。九月己卯，地震。庚寅，地又震。......郡国五山崩。】
【秋七月，梓潼山崩......元嘉元年春正月，京师疾疫......二月，九江、庐江大疫......京师旱。任城、梁国饥，民相食......秋七月，武陵蛮叛......十一月辛巳，京师地震......丙辰，京师地震......秋七月庚辰，日有食之...冬十月乙亥，京师地震...秋七月，郡国三十二蝗。河水溢。百姓饥穷，流冗道路，至有数十万户，冀州尤甚...癸卯，京师地震】【六月，彭城泗水增长逆流...京师蝗。东海朐山崩...九月丁卯朔，日有食之...蜀郡李伯诈称宗室，当立为“太初皇帝”，伏诛...太山、琅邪贼公孙举等反叛，杀长吏...二月，司隶、冀州饥，人相食...六月，洛水溢，壤鸿德苑...巴郡、益州郡山崩...南匈奴左薁鞬台耆、且渠伯德等叛，寇美稷...三月，蜀郡属国夷叛...秋七月，鲜卑寇云中...太山贼公孙举等寇青、兖、徐三州...十二月，京师地震...夏四月，九真蛮夷叛...闰月庚辰晦，日有食之...京师蝗。秋七月，河东地裂...长沙蛮叛，寇益阳...甲戌晦，日有食之。京师蝗...秋七月己巳，云阳地裂...十二月，鲜卑寇边...蜀郡夷寇蚕陵，杀县令...六月，鲜卑寇辽东...大将军梁冀谋为乱。...烧当等八种羌叛，寇陇右...闰月，烧何羌叛，寇张掖...白马令李云坐直谏，下狱死...五月甲戌，汉中山崩...长沙蛮寇郡界...太山、琅邪贼劳丙等复叛，寇掠百姓...太山贼叔孙无忌攻杀都尉侯章...四年春正月辛酉，南宫嘉德殿火。戊子，丙署火。....大疫。二月壬辰，武库火。...五月辛酉，有星孛于心。丁卯，原陵长寿门火。己卯，京师雨雹。...六月，京兆、扶风及凉州地震。庚子，岱山及博尤来山并颓裂。...雩（古代为求雨而举行的一种祭祀）.

桓灵二帝时，自然灾害频发，什么地震，蝗灾，洪水，轮流来。所以哪怕范晔这种人，写后汉书都不得不说出，天厌汉德久矣。

几百万那仅仅是可统计的人口，就像我们现在说的宇宙的大小，那仅仅是可观测宇宙的大小，就是说以你现在的技术手段只能观测到这么远的距离，但并不代表宇宙就只有你可以观测到的这么大。
汉末灾祸、战乱频发，大量的流民根本不可能被统计到，流动人口今天在这儿明天就不在这儿了，你怎么统计？
到三国鼎立时流民是少了，但是在此前几十年的混乱过程中出现了大量的隐户，即各大族的庇护起来为自己做事的人口，这些人口数量非常多，每家都有，也不会上报为朝廷的在编人口，朝廷也根本管不到。
还有其他特殊身份的人口，典型的就是曹魏的屯田户，他们的身份不是计算在州郡人口而是单独计算户口的，280年西晋的人口是1616万（注意，这是朝廷可统计到的人口），仅仅两年后的282年，西晋人口就变成了2380万，两年间多了近800万人？两年就算全天下一个人都不死，也根本不可能增加这么多的比例。2年间这多出来的近800万正是因为调整了人口统计口径。而这也不是当时西晋的全部人口，仅仅是朝廷能统计到的人口。
280年三家归晋，按之前三家分别的人口统计，曹魏443万，孙吴240万，蜀汉94，那这加起来都不到800万，西晋怎么可能在刚刚统 一的时候就翻倍人口了（从不到800万变成了1600万+）？正是因为调整了人口统计的口径，之前很多不在州郡编的人口变成了州郡人口。最典型的就是265年前后，即西晋代魏期间，废除了曹魏实行了几十年的屯田制，屯田人口是单独计算户口，他们是不计算在州郡户口里的，曹魏屯田人口至少在百万以上（有相关学术文献的分析，有兴趣的可以去找来看看），废除屯田后这些屯田人口的身份从屯田户一下就变成了州郡人口，这是为什么西晋刚建立不久人口就远远多于三国人口的重要原因。
所以所谓汉末只有几百万人口，简单总结来说，就是统计算法不一样。当然，除了计算方法，战乱、灾祸也是减少人口的重要原因，但绝对不会减少到那么多。汉末三国所有人口加一起，并且按之前东汉还没崩的时候用的同样的计算方法，应该在3000万左右（有相关学术文献的分析，有兴趣的可以去找来看），这比东汉朝廷最后一次统计的5600万还是少了很多的。

楼上已经说了不少了。。。我要强调一点
黄巾起义是因为老百姓活不下去了才起来造反，不是因为它造成老百姓活不下去

饿死

饥荒瘟疫