9路：金家村桥东——金台路
11路：大北窑东——孛罗营
23路：虎坊桥——朝阳半壁店
28路：东大桥——弘燕公交场站
29路：北京站——弘燕公交场站
31路：金蝉南里——甜水园街北口
34路：虎坊桥路口东——孛罗营
35路：天桥——高碑店东路首末站
41路：东单路口南——金蝉西路南口
43路：团结湖——五间楼
140路：北京站——石佛营（原611路，2006年8月更名440路，2014年3月更名专111路，2015年5月延伸至北京站并更名140路至今）
306路：蟹岛度假村东门——地铁草房站
312路：东小营公交场站——马圈
316路：疃里公交场站——小稿村南站
317路：怡乐南街公交场站——绿心公园南门
322路：四惠枢纽站——古城南街公交场站
342路：翠福园小区——古城南街公交场站
348路：大北窑南——大鲁店公交场站
350路：东大桥——焦庄桥北
363路：四惠枢纽站——青青家园
364路：双桥农场西站——金盏
372路：怡乐南街公交场站——自新路西口
378路：华威路南口——老君堂北站
382路：大北窑东——双桥农场西站
388路：大北窑东——疃里公交场站
397路：四惠枢纽站——大鲁店公交场站
435路：通州五里桥——地铁临河里
439路：十里河桥西——百子湾
451（运通111）路：来广营北——黄厂路
513路：唐家村——吕营家园
561路：大北窑南——西直河公交场站（原专线客运分公司743路，2009年4月由于甘雨桥施工一分为二，同年7月北段更名为562路[现已撤销]，南段更名为561路至今）
582路：怡乐南街公交场站——地铁通州北关
589路：疃里公交场站——环球度假区首末站
591路：通州西站——乔庄
637路：北京站——次渠
638路：北京站——化工桥西
647路：大北窑东——万盛南街
专5路：东大桥——团结湖
专10路：大北窑南——弘燕公交场站
专36路：地铁传媒大学南——地铁传媒大学南
专39路：五里桥——杨闸
专64路：地铁通州北关——疃里公交场站
专71路：地铁百子湾——百子湾家园东站
专72路：朝阳老君堂——华威桥南（原新奥客运分公司852路，2010年11月更名621路，2016年12月拆分为新621路和专72路至今）
专87路：广渠门——百子湾家园东站
专88路：地铁通州北关——疃里公交场站
专113路：四惠枢纽站——百子湾家园东站
专114路：东大桥——燕莎桥南
专141（运通121）路：华纺易城公交场站——八王坟东
专142（运通122）路：华纺易城公交场站——农业展览馆
专157路：通州西站——地铁通州北关
专158路：翠福园小区——北京物资学院
专159路：次渠——经海五路南口
专165路：双花园西里——八王坟南
专166路：金蝉北路西口——金蝉南里
专170路：黄厂路——豆各庄公交场站
专172路：怡乐南街公交场站——万盛南街
专175路：常营体育公园——皮村西口
专203路：地铁临河里——东小营公交场站
专204路：北京东站——光辉桥南
专205路：地铁潞城站——通州火车站
专207路：次渠——地铁嘉惠湖
临6路：地铁焦化厂——化工桥西
夜19路：化工桥西——北京站
夜25路：华威路南口——石各庄
夜27路：古城南街公交场站——大北窑东
夜29路：东小营公交场站——北京站
通6路：北京物资学院——潞阳桥西路
通7路：疃里公交场站——周坡庄村委会
通8路：北京物资学院——关辛庄村
通14路：地铁通州北关——黄厂铺村
通17路：地铁通州北关——王辛庄
通18路：日新路南口——平家疃
通37路：地铁通州北关——王辛庄
通44路：疃里公交场站——东直门医院通州院区
通52路：地铁通州北关——李庄家苑
通70路：地铁通州北关——疃里公交场站
通71路：日新路南口——晔秀路北口
通114路：地铁通州北关——香溪郡小区
孛罗营临线：地铁双合站——孛罗营
2022年6月1日，陪伴了通州乘客24年的“恒基”正式和北京公交合并，其中，除地铁通州北关、北京物资学院的通字头划转至第五客运分公司，刘庄跟京东运乔建材城的通字头划转至专线客运分公司，地铁土桥、柴厂屯的通字头划转至八方达通州分公司外其他通字头线路一律划转至北京公交城市副中心客运分公司。