水的三类综合评价指标包括化学指标、生物指标和物理指标。其中化学指标主要评价水的化学成分，如pH值、溶解氧、硬度、有机物含量、重金属和细菌等；生物指标主要评价水体中的生物群落结构和数量，如藻类、浮游生物、底栖动物和鱼类等；物理指标主要评价水的物理特性，如水质透明度、水温、流速、水深和水体表面波动等。这三类指标的综合评价可以全面反映水质的优劣程度，为水资源管理和保护提供科学依据。

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