不会影响仲裁。法定代表人更换并不能影响仲裁，主要是由当事人自身的自然或者法人资格确定，而不是由代表本身去确定。因此，更换代表人对仲裁程序不会造成任何影响，只要当事人能够提供证明其资格的文件。在仲裁过程中，当事人可以更换法定代表人，如果有变更，需要提前通知书面形式提交给仲裁庭，并通知相关当事人。避免仲裁庭的判决不能及时有效地对当事双方生效。