高铁三位数和两位数的区别主要是指高铁车次的编号。高铁三位数一般是指始发站或终点站在省会城市、直辖市或特别行政区的高速动车组列车，而两位数则是指其他地区的高速动车组列车。例如，G5、G112等均为高铁三位数，而G4、G12等则为两位数。此外，高铁三位数的票价一般较高，服务也更加周到。