内蒙古民族大学共有21个院系，它们分别是：经济管理学院、法学院、文学院、历史学院、外国语学院、数学与信息科学学院、物理学院、化学与生命科学学院、地理与遥感科学学院、生物技术学院、财经学院、体育学院、公共管理学院、艺术学院、北极学院、计算中心、分子生物学研究所、图书资料中心、新闻传播学院和继续教育学院。此外，内蒙古民族大学还设有研究生院、继续教育学院、新信息学院、地方自治学院、卓越学院和智能信息与信息安全学院。内蒙古民族大学的学术科研实力雄厚，以及国内外学术交流能力强，为培养优秀高素质的人才奠定了坚实的基础。