转基因玉米通常采用植物保护剂防治草害，但是现在也有许多转基因玉米抗草剂，可以在种植玉米的季节前施用，而且使用的效果要好于传统的植物保护剂。，转基因玉米打除草的时间应在玉米播种前到播种后两周之内，这样可以在玉米萌芽前就能根除杂草，从而节省宝贵的施肥资源，增加玉米的收获率。