水蛭素是从吸血性水蛭头部唾液腺内提取出来的生物活性物质。它是一种单链环肽化合物，由65～66个氨基酸组成，其分子量很小，仅为7000道尔顿。水蛭除其唾液腺含有水蛭素外，身体其他部位并不含有水蛭素。