从天启二年九月至天启三年二月,孙承宗、马世龙等人经过惨淡经营,创建了关宁军的雏形—关门五部军,孙承宗选定的大将是马世龙。马世龙,字苍渊,宁夏人。他由世职举武会试,曾经担任宣府游击,后援辽,任三屯营总兵。孙承宗上任前路过三屯营,见他治军严整,颇有条理,于是令其佩平辽将军印,行授钺,总管山海关诸军。马世龙也是关宁军首任全军主将。孙承宗向朝廷报告说:
臣抵关以来,惟有操纵将吏以提掇其心志,而厚储其气。顷者仰蒙皇上以马世龙为主将,以王世钦、尤世禄左提右契,马世龙管中部,当以建昌路隶之。王世钦管南三路三辖,仍以虎符为重。故南北两部皆在世龙节制之中,而三路兼统于中总,且世龙既佩平辽将军印,特赐尚方剑,为皇上神武辽谟,谓大将军专制阃外,非专生杀无以制三军,臣何敢轻为世龙请?然窃意皇上或不为世龙靳,世龙事权既重,似当重其章服,去其团秩,实授府衔。官不加增,可资弹压,可以荣及其亲。盖御将之道,不予以轻则权重,不夺其重则权专。伏望皇上俯察臣言,勅下兵部,拟以实授府衔,予以应得制勅。或特恩赐尚方剑,以资弹压。尤世禄、王世钦各予以制勅关防,分辖两路而节制于中部,勅各该督抚司道与各该将领共事者当精简其庸懦,不得鄙夷其人而轻制之,当力助其强梁,不可过疑其人而抑之。其权专则其气不挫,其气厚则其心不纷,于边防未必无补矣。
可见,孙承宗为了提高马世龙的地位,竭力为其做担保。马世龙的副手为尤世禄、王世钦。尤世禄,陕西榆林人。天启二年(1622)中武进士,曾担任宁夏总兵、山海关总兵。王世钦,明后期将领。榆林卫(今陕西榆林)人。大将王威之子。可见尤世禄、王世钦也是一时之猛将,于是在孙承宗的调配下,关宁军形成了马-尤-王体制,在这个体制中,马世龙直接管理的是山海关中部防线,后在孙承宗的要求下,又将建昌一路隶属马世龙麾下。自关城至南海口为南部,王世钦为统帅,而以关以内在卫城之北,至角山五里之地为北部,尤世禄为主帅,此山海关三部之军,可视为关宁军最早的雏形。