1.不是两个，每一个都是不同文明。（幽邃圣主和智慧之神是同一文明的造物，但幽邃不是四神之一）
2.男主是他背后的文明的科技造物（逆奇点），整个公寓包括男主是一个整体，之所以呈现出公寓的样子，是因为男主认为它是这样的。
3.四神都是世界的惯性，其文明程度各异，除了领航2号（智慧之神）是星际文明，其他都没有走出自己的母星。文明程度最高的主角文明也没有走出自己的宇宙，只是到了超然临界，还差最后一步。

剧透警告
1主角和四神各自代表着不同的文明
2高，但不知道高多少。他们知道将要发生什么并留下“有效”手段，其他文明显然没有走到这一步
（剧透警告，我还是想剧透，以下剧透带有很多个人看法）3大湮灭是什么？不知道。但它造成了大片世界破碎。这些世界化作大大小小碎片世界逐渐被虚空“吞噬”。深海是各种碎片堆积而成的世界，一点一点被虚空吞噬
4尽量不要跨作品论战（懂得都懂）。本书中的神处于一个微妙的状态。涉及部分希灵帝国里的设定，每个世界都有自己的法则和“核心”。世界破碎后，碎片会尝试维持稳定形成个“核心”。而四神就是这样的存在。世界破碎前可能是一个强大个体、信息聚合体、图腾崇拜，世界破碎后被强行“升格”为神明

我表达能力比较差，但我还想说一下。他们被选中是因为他们是信息活跃点。逃亡舰队中所有人都是休眠状态靠就三台主机还活跃着（爱丽丝是处于崩溃状态的导航机就不用管了，幽邃圣主和智慧之神可是在稳定运行中）。风暴女神和永燃薪火是信仰中的神明

另外有一点是可以确定的，所有的文明包括周铭本人都没到能跨世界的程度

1，是五个不同的文明。四神也来自不同的文明。
2，是。他们发展到超然临界的阶段，有能力改写宇宙规律，观测到大湮灭的临近，差一步冲出宇宙，并在大湮灭中保存下宇宙0.002秒的快照(周铭)。仅次于他们的是幽邃圣主和拉赫姆的文明，走到超然临界前的门槛。
3，大型车祸现场。一堆宇宙撞在一起，宇宙规律的不兼容导致一切都崩溃成基本信息元(灰烬)，旧世界的惯性使一部分灰烬重聚成它们曾经的模样(包括四神在内的远古诸王)，诸王又从尚未冷却的灰烬中塑造出整个庇护所(无垠海，包括里面的生命)，所以只有周铭不是灰烬。
4，请不要跨世界观论战，谢谢。
深海的各个文明落差其实很大，智慧之神拉赫姆和幽邃圣主的文明靠时间荚囊保了母星一个世纪，建了新希望号，有中子星外壳，超光速跃迁引擎和三个智慧生命级别的强人工智能，其中拉赫姆近似拉普拉斯妖。
死神巴托克背后没有文明，他是他那个宇宙的死亡本身。
黑太阳的文明是恒星级，有戴森球。
永燃薪火(历史)塔瑞金、风暴女神葛莫娜、梦境之王萨斯洛卡他们的三个文明目前看来没到星际时代

大湮灭来自于宇宙之间的碰撞，而这个碰撞有猜测是异常生物见闻录里的螺旋谷战役导致，深海这几个碰撞的宇宙也只不过是其中几个倒霉蛋，当然这只是猜测，具体害得看异度旅社里会不会具体提到