在工厂宿舍中，男女混居一个卧室是不被推荐的，尽管法律并没有明确禁止这种安排，但是出于对员工隐私权和人身安全的考虑，应当尽量避免。根据《中华人民共和国劳动法》第五十九条的规定，雇主有责任为员工提供符合卫生标准的宿舍，保障员工的生活条件，但该法未对员工宿舍的性别分配做出明确规定 。同时，《民法典》第一千零三十二条明确指出自然人享有隐私权，任何组织或个人不得侵害他人的隐私权 。
在实际操作中，企业应当尽量按照性别分配宿舍，以维护员工的个人权益，避免可能引发的隐私侵犯或性别歧视等问题。如果因为资源有限等原因需要男女混住，企业应当制定相应的规章制度，确保宿舍管理的合理性和公正性，尊重员工的隐私权和人身安全 。如果员工对于住宿安排有异议，建议通过友好协商的方式解决，或者寻求法律专业人士的帮助 。