在《九阴真经》中，没有绝对最厉害的门派，各门派都有其独特优势和特点，以下是各门派的大致情况：
近战方面
• 少林：
• 优势：具有强大的控制能力，比如有强力的群体眩晕技能，在团队战斗中能起到很好的控制作用，为队友创造输出环境。内功方面血厚防高，生存能力较强，可在战斗中充当前排角色，承受较多伤害。
• 劣势：行动能力差，容易被机动性强的门派风筝，且控制技能多是周围内控制，面对灵活的对手时，技能命中率可能受影响。
• 丐帮：
• 优势：比较中庸但颇具特色，爆发力堪称数一数二，其技能以击飞、喷酒（使人醉酒，头晕眼花，屏幕会模糊）等骚扰型技能为主，单体 PK 时“抱妹杀”对于喜欢呆在空中的武当等职业有一定压制性。
• 劣势：移动能力比较中庸，和少林一般惧怕被风筝，不过风筝丐帮颇需要技术。
远程方面
• 唐门：
• 优势：作为昔日区测中以一敌三的门派，唐门是唯一的远程职业，在移动中可以释放技能。其特色是单体远程攻击，25 米的输出距离在 8 大门派中也只有锦衣的飞爪可以媲美，飞镖是唯一一套可以边跑边使用的招式，加上唐门的加速技能和高暴击，在野外战斗中杀人非常轻松。
• 劣势：作为纯单体职业，没有群攻技能是唐门的软肋。
• 武当：
• 优势：具有强大的群攻能力，是门派战等群战中的主角。主修内功，早期有坑但太极剑的成长性很高，天马行空和三环套月都是很强力的技能，等级越高越厉害，还可以将自己的蓝和血互换，生存能力很强。
• 劣势：控制技能很少，行动能力缺乏，面对近战突进能力强的门派，容易陷入被动。
辅助方面
• 峨眉：
• 优势：峨眉的辅助能力九阴第一，其招牌是减伤，掌法大招 12 秒内减伤 70%，加上一内满层的格挡减伤 90%效果在初期基本是不死的存在。后期匕首的控制和掌法的减速都是 PK 的利器，双刺的群晕和超高伤害在副本中也很犀利。
• 劣势：必须是女性角色才能加入，这限制了部分玩家的选择，且在机动性方面相对其他门派可能稍显不足。
综合方面
• 君子堂：血量很高，近身群战有几乎无敌的“大风车”，腿法单体攻击应该是各大门派中最高的，而且在不叠加加速技能的情况下君子的速度是各门派中最快的，还有很强的群体辅助能力，可以给团队持续回蓝加伤害。
• 极乐谷：同为邪派，和锦衣卫一样有大量的控制和吸血类技能，但在综合实力上没有特别突出的单项优势，不过其诡异的武学在特定情况下也能发挥出意想不到的效果。