处理税务异常，需先明确原因，再采取相应措施。以下是一些常见原因及其处理方法：
1、未按时申报纳税：及时联系税务机关，补申报并缴纳税款及滞纳金。
2、长期零申报：若有未开票收入也需申报，若无经营可做税务注销。
3、经营地址异常：先变更为税务认定的地址，再处理税务异常。
4、关联公司异常：先处理关联公司异常，再向税务专管员说明情况。
5、偷税漏税：补缴税款及罚款，再到税务机关解除异常。
6、发票问题：如低开、虚开等，需补缴税款及罚款，并改正行为。
处理时，应注意：
自查并纠正错误，如补缴税款、调整账目等。
向税务机关提供情况说明及申请材料，配合调查核实。
根据调查结果，进行补充申报、补缴税款等操作。
加强内部管理，完善财务制度，预防税务异常再次发生。