首先单枚大当量核弹的作战效能远不及多枚中等威力核弹，所以沙皇炸弹那种级别的核弹还是算了吧，威力吓人但不实用
日本这个岛国地形复杂，山地较多，这会限制核弹的威力，日本还是一个经济发达国家，城市人口占了绝大多数，城市里的楼房也会对爆炸产生的冲击波起到一些阻挡作用，而且日本是一个多地震的国家，他们的建筑也相对比较坚固，在一定程度上可以抵抗核爆，如果用50万吨当量的核弹大概需要300枚，而且一波核打击不可能消灭太多日本人，还需要第二波第三波，所以至少得用300枚
在日本周边海域和空中需要飞机和军舰封锁，以防止幸存者逃离和外部人员对岛国输送物资。此处日本还有非常多的地下建筑，地铁站、防空洞和地下商场、地下娱乐场所甚至还有地下医院，这些地方囤积着大量物资，很多食物药品和医疗器械，幸存者依靠这些完全可以生存很长时间，所以等核爆产生的辐射基本消散后还需要派部队上岛进行清剿，对这些上岛人员还要做好思想工作，让他们明白日本是一个非常变态的民族，自古以来就对中国虎视眈眈，近现代由于科技赶超中国，对中国发起了残忍的侵略战争，而且至今毫无忏悔之心，仍然敌视中国，这样的民族必然是子孙后代的祸患，不可以有丝毫怜悯，必须彻底剿灭