“喂小智，有时间吗?”“大木博士，当然有啊！有啥事吗？”“有，小茂和小蓝都去了伊修地带，你和小黄没去，现在你们去吧！”“那怎么去啊！”“船票在我这，你过来拿吧！”于是小智来到了大木研究所。
只见大木博士和小黄在门口等着他。“这是伊修地带的图鉴，拿去吧。”大木博士将图鉴放到了小智和小黄的手里。“那，大木博士，我们去了。”小智和小黄对大木博士说道。
第一章（黑暗组织）
小智和小黄来到伊修地带的一片森林。
小智说：“小黄，你肚子饿了吧！你在这等我，我去前面摘树果。”“哦”小黄听了。靠在一棵树旁休息。
N分钟后。“小智哥怎么还没来，去了半个小时了。”小黄为小智担心道。小黄戴上草帽向前走去。“皮卡丘，没事吧！”“是小智哥的声音。”小黄向声音的来源跑去。只见小智在和一位穿黑色制服的男子决斗，哪位男子手里正抓住皮卡丘。“你是谁，为什么要抓我的皮卡。”“你既然不知道我们黑暗组织，真是可笑。”忽然从树丛里走出一个黑影来。“看来你是外地人。自我介绍一下，我叫Q，我是黑暗组织的干部之一。”“看来也是一个干尽坏事的组织。”小黄说道。“你叫小黄对吧！你说的不错，我们的确是这样。在伊修地带，皮卡丘可是很少见的。”Q笑着说道。小智和小黄听了大吃一惊 。 “那么再见了，怪怪蝙蝠，起风。”一眨眼，Q和小卒就不见了。“小智哥哥，你刚才怎么没让皮卡使出电击？为什么没放出其他的神奇宝贝？”“那人手上戴着防电手套，我怕他会对皮卡不利，所以没放出其他的神奇宝贝，他们应该没跑远，我们快追。”